More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1819 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  92.75 
 
 		 690 aa  1339    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.8 
 
 		 703 aa  725    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  81.88 
 
 		 692 aa  1200    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  55.27 
 
 		 712 aa  792    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  82.03 
 
 		 690 aa  1209    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 		 690 aa  1430    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  50.79 
 
 		 694 aa  717    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  92.9 
 
 		 690 aa  1343    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  92.9 
 
 		 690 aa  1343    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  80.61 
 
 		 691 aa  1184    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  51.65 
 
 		 691 aa  720    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.79 
 
 		 691 aa  732    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  92.9 
 
 		 690 aa  1343    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  97.39 
 
 		 690 aa  1399    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  97.83 
 
 		 690 aa  1405    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  78.87 
 
 		 691 aa  1160    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  81.45 
 
 		 692 aa  1187    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  81.88 
 
 		 690 aa  1188    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  97.39 
 
 		 690 aa  1398    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  83.5 
 
 		 691 aa  1216    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  51.39 
 
 		 686 aa  725    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  93.77 
 
 		 690 aa  1362    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  41.74 
 
 		 708 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.53 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  38.53 
 
 		 714 aa  492  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.6 
 
 		 714 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  38 
 
 		 714 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.63 
 
 		 721 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.65 
 
 		 714 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.55 
 
 		 714 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.57 
 
 		 725 aa  475  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.68 
 
 		 714 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.22 
 
 		 720 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.41 
 
 		 714 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.41 
 
 		 714 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  38 
 
 		 714 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.51 
 
 		 714 aa  458  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.64 
 
 		 707 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.27 
 
 		 711 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.13 
 
 		 700 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.11 
 
 		 710 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.9 
 
 		 725 aa  363  8e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.68 
 
 		 729 aa  362  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.54 
 
 		 758 aa  362  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.65 
 
 		 716 aa  360  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.57 
 
 		 762 aa  358  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.38 
 
 		 714 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.57 
 
 		 716 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.38 
 
 		 714 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  34.57 
 
 		 716 aa  357  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  34.57 
 
 		 716 aa  357  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  34.57 
 
 		 716 aa  357  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.38 
 
 		 714 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.04 
 
 		 732 aa  356  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.38 
 
 		 714 aa  357  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.57 
 
 		 716 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.57 
 
 		 716 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.24 
 
 		 714 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.55 
 
 		 692 aa  355  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.8 
 
 		 726 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.8 
 
 		 726 aa  354  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.42 
 
 		 716 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.8 
 
 		 726 aa  353  5.9999999999999994e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.9 
 
 		 715 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 		 699 aa  346  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.29 
 
 		 699 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.94 
 
 		 701 aa  345  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.36 
 
 		 716 aa  345  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.86 
 
 		 741 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  32.36 
 
 		 750 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.07 
 
 		 738 aa  333  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  30.8 
 
 		 876 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  31.82 
 
 		 843 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  31.07 
 
 		 640 aa  271  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  30.47 
 
 		 840 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  30.39 
 
 		 851 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  27.82 
 
 		 832 aa  261  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.98 
 
 		 957 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  32.43 
 
 		 659 aa  255  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  30.91 
 
 		 651 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  30.76 
 
 		 643 aa  252  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  28.45 
 
 		 822 aa  252  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.5 
 
 		 930 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  30.16 
 
 		 636 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  29.54 
 
 		 838 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  29.56 
 
 		 707 aa  248  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  28.23 
 
 		 846 aa  244  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  29.23 
 
 		 929 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  30.04 
 
 		 729 aa  243  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  28.49 
 
 		 639 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  30.01 
 
 		 649 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  28.01 
 
 		 668 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.85 
 
 		 652 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  29.17 
 
 		 653 aa  230  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  26.88 
 
 		 709 aa  229  1e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  29.66 
 
 		 652 aa  229  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  27.88 
 
 		 646 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  28.3 
 
 		 646 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3670  helicase c2  29.14 
 
 		 664 aa  226  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.978483  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  28.43 
 
 		 674 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>