More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1725 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  100 
 
 
264 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  98.86 
 
 
272 aa  544  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  98.86 
 
 
272 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  98.86 
 
 
272 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  97.73 
 
 
272 aa  540  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  97.73 
 
 
272 aa  540  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  97.73 
 
 
272 aa  540  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  97.73 
 
 
272 aa  540  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  98.11 
 
 
272 aa  540  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  93.56 
 
 
272 aa  521  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  93.18 
 
 
272 aa  517  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  93.56 
 
 
272 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  93.56 
 
 
272 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  92.05 
 
 
272 aa  516  1e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  92.8 
 
 
272 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  91.29 
 
 
272 aa  501  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  80.69 
 
 
279 aa  444  1e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  76.45 
 
 
272 aa  427  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  76.45 
 
 
272 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  76.83 
 
 
273 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  75.86 
 
 
272 aa  414  1e-115  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
277 aa  416  1e-115  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0148  phosphate transporter ATP-binding protein  75.59 
 
 
277 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  75.59 
 
 
277 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6145  phosphate transporter ATP-binding protein  74.51 
 
 
277 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5612  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 
277 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8399  normal  0.188753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  74.9 
 
 
270 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  74.8 
 
 
277 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70810  phosphate transporter ATP-binding protein  74.51 
 
 
277 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.356471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  74.8 
 
 
281 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5038  phosphate transporter ATP-binding protein  73.33 
 
 
277 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.268746  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  74.12 
 
 
285 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0182  phosphate transporter ATP-binding protein  71.22 
 
 
277 aa  406  1e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3116  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
262 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1347  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
270 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1230  phosphate transporter ATP-binding protein  74.52 
 
 
270 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  73.2 
 
 
285 aa  400  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  72.44 
 
 
276 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  72.11 
 
 
284 aa  395  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  71.26 
 
 
272 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  68.5 
 
 
276 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  69.11 
 
 
271 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5484  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  72.55 
 
 
277 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  70.98 
 
 
283 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  70.16 
 
 
271 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  69.77 
 
 
271 aa  381  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2669  phosphate transporter ATP-binding protein  67.95 
 
 
271 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  67.45 
 
 
261 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  67.2 
 
 
258 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  63.22 
 
 
268 aa  363  2e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  66.4 
 
 
260 aa  357  2e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  65.46 
 
 
253 aa  353  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  64.37 
 
 
262 aa  351  8e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.31 
 
 
251 aa  349  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 
262 aa  348  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  63.56 
 
 
262 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.16 
 
 
252 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  62.99 
 
 
253 aa  347  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.16 
 
 
252 aa  346  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.2 
 
 
301 aa  346  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.97 
 
 
253 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.2 
 
 
273 aa  345  3e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3265  phosphate ABC transporter permease  64.59 
 
 
257 aa  345  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  62.8 
 
 
260 aa  345  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.75 
 
 
255 aa  345  4e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  65.02 
 
 
255 aa  345  5e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  65.99 
 
 
252 aa  345  6e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.8 
 
 
251 aa  345  6e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1376  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.63 
 
 
260 aa  343  1e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000114898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
258 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2548  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.31 
 
 
292 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001265  phosphate transport ATP-binding protein PstB  64.78 
 
 
249 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 
251 aa  342  3e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.56 
 
 
251 aa  342  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0066  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
251 aa  342  4e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0711697  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.75 
 
 
253 aa  342  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05140  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.78 
 
 
249 aa  342  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
253 aa  341  6e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.3 
 
 
254 aa  340  9e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.21752e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4349  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  340  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  63.52 
 
 
256 aa  340  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4171  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4009  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  340  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4019  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  340  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4289  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.010131 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4493  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4402  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1616  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.73 
 
 
260 aa  339  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.91963e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4385  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  339  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0851  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  339  3e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2997  phosphate transporter ATP-binding protein  63.31 
 
 
271 aa  338  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.65 
 
 
253 aa  338  6e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1303  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.51 
 
 
259 aa  338  7e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.673171 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.75 
 
 
269 aa  337  1e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  63.2 
 
 
265 aa  337  1e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.73 
 
 
267 aa  337  1e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.80282e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  63.22 
 
 
252 aa  337  2e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.2 
 
 
252 aa  337  2e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3821  ABC-type phosphate transporter, ATP-binding protein  61.13 
 
 
249 aa  335  3e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.16 
 
 
249 aa  335  4e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>