268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1694 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.96 
 
 
864 aa  995    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  100 
 
 
894 aa  1867    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.77 
 
 
614 aa  776    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  56.55 
 
 
864 aa  1003    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  55.85 
 
 
864 aa  994    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  78.27 
 
 
896 aa  1452    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  78.27 
 
 
896 aa  1453    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  59.29 
 
 
891 aa  1073    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  79.45 
 
 
896 aa  1462    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  41.57 
 
 
563 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.37 
 
 
574 aa  301  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  32.47 
 
 
577 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1512  FAD-binding protein  46.28 
 
 
274 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.592661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.53 
 
 
449 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  32.98 
 
 
461 aa  125  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  34.83 
 
 
479 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  35.64 
 
 
461 aa  120  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  34.64 
 
 
479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.51 
 
 
444 aa  119  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
462 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  33.85 
 
 
462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.37 
 
 
461 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  32.77 
 
 
463 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  34.92 
 
 
448 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  28.57 
 
 
474 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.57 
 
 
461 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  29.95 
 
 
479 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 
464 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  32.04 
 
 
458 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  34.22 
 
 
463 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.81 
 
 
481 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.21 
 
 
474 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  30.54 
 
 
448 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  29.23 
 
 
473 aa  108  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 
479 aa  107  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.02 
 
 
478 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  31.03 
 
 
448 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  28.34 
 
 
473 aa  101  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.52 
 
 
478 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.77 
 
 
469 aa  99.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.96 
 
 
705 aa  99  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2543  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 
456 aa  98.6  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  34.22 
 
 
461 aa  98.6  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  29.14 
 
 
499 aa  98.2  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  29.63 
 
 
465 aa  96.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  29.74 
 
 
468 aa  96.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.55 
 
 
466 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.05 
 
 
465 aa  96.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  31.22 
 
 
444 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  30.5 
 
 
465 aa  95.5  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.16 
 
 
472 aa  95.1  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  31.43 
 
 
456 aa  94.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  28.65 
 
 
459 aa  94.4  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.78 
 
 
459 aa  94  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  36.81 
 
 
764 aa  94  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  30.48 
 
 
465 aa  92.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 
532 aa  92.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  34.34 
 
 
480 aa  92  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  32.5 
 
 
466 aa  91.3  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 
490 aa  90.1  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  34.46 
 
 
446 aa  90.1  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  29.22 
 
 
444 aa  90.1  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  31.29 
 
 
469 aa  89.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  25.71 
 
 
471 aa  88.6  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  30.73 
 
 
448 aa  89  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  32.26 
 
 
501 aa  88.2  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  30.68 
 
 
456 aa  87.8  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  30.73 
 
 
460 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  29.19 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 
484 aa  86.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  31.72 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0639  FAD linked oxidase domain protein  29.12 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  26.46 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  31.06 
 
 
602 aa  84.3  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  31.29 
 
 
470 aa  84  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05550  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
482 aa  83.2  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.4 
 
 
805 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.258933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2963  FAD binding domain-containing protein  31.4 
 
 
805 aa  82.8  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276895 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06807  conserved hypothetical protein  27.98 
 
 
982 aa  82  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.522291  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.7 
 
 
492 aa  81.6  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08964  conserved hypothetical protein  33.72 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.61 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  31.67 
 
 
456 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3907  twin-arginine translocation pathway signal  24.5 
 
 
489 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  31.07 
 
 
461 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03399  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17690)  30.73 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.31125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 
451 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  27.37 
 
 
477 aa  77.4  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 
476 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  26.71 
 
 
465 aa  77.4  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  28.25 
 
 
460 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  33.88 
 
 
479 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  28.5 
 
 
461 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.24 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  27.51 
 
 
473 aa  75.1  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  28.1 
 
 
752 aa  74.7  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.78 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.32 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>