More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1647 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  73.2 
 
 
653 aa  918    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  100 
 
 
648 aa  1286    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  87.65 
 
 
648 aa  1109    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  75.5 
 
 
649 aa  974    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  87.5 
 
 
648 aa  1124    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  87.35 
 
 
648 aa  1120    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  76.53 
 
 
648 aa  937    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  76.46 
 
 
649 aa  951    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  75.65 
 
 
649 aa  959    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  87.65 
 
 
648 aa  1125    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  74.35 
 
 
649 aa  963    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  95.68 
 
 
648 aa  1200    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  95.68 
 
 
648 aa  1200    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  73.12 
 
 
650 aa  944    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  94.29 
 
 
648 aa  1201    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  45.87 
 
 
720 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  47.48 
 
 
657 aa  595  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  44.07 
 
 
655 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  43.35 
 
 
654 aa  491  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  40.15 
 
 
662 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  40.75 
 
 
659 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  40.9 
 
 
674 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  40.31 
 
 
656 aa  435  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  40.76 
 
 
660 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  40.45 
 
 
660 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  41.3 
 
 
659 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.79 
 
 
680 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  41.12 
 
 
659 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
661 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  40 
 
 
661 aa  419  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  39.39 
 
 
661 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.81 
 
 
654 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  37.85 
 
 
652 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  41.3 
 
 
659 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  40.97 
 
 
658 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  38.47 
 
 
668 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  38.16 
 
 
666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  39.58 
 
 
667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 
667 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  38.7 
 
 
668 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  38.7 
 
 
668 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  38.7 
 
 
668 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  38.91 
 
 
678 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  38.75 
 
 
661 aa  397  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  38.4 
 
 
663 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  39.28 
 
 
666 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  38.78 
 
 
663 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  39.88 
 
 
661 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.67 
 
 
669 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.67 
 
 
669 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  38.67 
 
 
669 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.67 
 
 
669 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.67 
 
 
669 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  38.32 
 
 
670 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.67 
 
 
669 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  38.6 
 
 
670 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  38.7 
 
 
664 aa  389  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  38.49 
 
 
665 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  38.92 
 
 
661 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  37.96 
 
 
661 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  40.03 
 
 
661 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  38.24 
 
 
655 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  33.13 
 
 
674 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  31.57 
 
 
671 aa  365  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.9 
 
 
579 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  34.47 
 
 
636 aa  362  2e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  33.04 
 
 
666 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  42.15 
 
 
570 aa  355  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.08 
 
 
697 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
658 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 
666 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  33.14 
 
 
672 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.75 
 
 
574 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.21 
 
 
665 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 
664 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.9 
 
 
572 aa  325  2e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  30.02 
 
 
682 aa  323  7e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  37.46 
 
 
568 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  32.01 
 
 
666 aa  320  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.73 
 
 
663 aa  319  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
741 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  32.82 
 
 
688 aa  317  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  36.41 
 
 
591 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  36.64 
 
 
583 aa  314  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  35.71 
 
 
593 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  33.83 
 
 
624 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  33.67 
 
 
665 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0907  sodium/hydrogen exchanger  34.91 
 
 
563 aa  311  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 
656 aa  311  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0988  sodium/hydrogen exchanger  33.38 
 
 
676 aa  309  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  35.05 
 
 
693 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29.63 
 
 
664 aa  306  7e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  35.63 
 
 
597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  36.3 
 
 
629 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3825  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.77 
 
 
601 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.450061  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3654  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.77 
 
 
601 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0814431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0528  potassium efflux system protein  35.12 
 
 
604 aa  303  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.408395 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3930  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  35.08 
 
 
602 aa  303  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.423778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0254  sodium/hydrogen exchanger  35.87 
 
 
595 aa  302  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.711555  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  38.58 
 
 
601 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.538189  normal  0.242525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>