31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1614 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1614  acetyltransferase  100 
 
 
212 aa  441  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2655  GCN5-related N-acetyltransferase  90.09 
 
 
212 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  89.15 
 
 
212 aa  395  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2722  GCN5-related N-acetyltransferase  89.15 
 
 
212 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  84.43 
 
 
212 aa  380  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2917  GCN5-related N-acetyltransferase  83.49 
 
 
215 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170067  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1437  GCN5-related N-acetyltransferase  83.02 
 
 
215 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1431  GCN5-related N-acetyltransferase  83.49 
 
 
215 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1467  GCN5-related N-acetyltransferase  83.49 
 
 
215 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.770866  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  69.67 
 
 
215 aa  315  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000278112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1255  GCN5-related N-acetyltransferase  68.6 
 
 
209 aa  314  7e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3173  GCN5-related N-acetyltransferase  67.3 
 
 
215 aa  310  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  67.92 
 
 
212 aa  308  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.289244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  69.42 
 
 
216 aa  308  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  65.57 
 
 
212 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1126  acetyltransferase  65.57 
 
 
213 aa  296  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3529  hypothetical protein  47.29 
 
 
223 aa  197  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3188  hypothetical protein  47 
 
 
214 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03041  predicted acetyltransferase, GNAT family  43.72 
 
 
215 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2891  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0118501  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.17689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2891  acetyltransferase  30.43 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00698581  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  29.95 
 
 
216 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130564  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3648  acetyltransferase  30.37 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2477  hypothetical protein  31.79 
 
 
223 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.184959  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2748  hypothetical protein  31.79 
 
 
223 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.176962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2435  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
214 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272876  normal  0.75781 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28870  GCN5-related N-acetyltransferase  30.73 
 
 
223 aa  101  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.114287  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1358  GCN5-related N-acetyltransferase  30.81 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2693  hypothetical protein  28.04 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31660  hypothetical protein  27.37 
 
 
237 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.286419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>