30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1568 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1568  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2770  YfaZ family protein  93.3 
 
 		 179 aa  345  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000254967  normal  0.114256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2702  YfaZ family protein  92.18 
 
 		 179 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000258539  hitchhiker  0.0000794475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2872  YfaZ family protein  92.18 
 
 		 179 aa  340  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00022374  hitchhiker  0.00192784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1303  YfaZ family protein  89.94 
 
 		 179 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1387  YfaZ family protein  87.15 
 
 		 179 aa  330  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1371  YfaZ family protein  87.15 
 
 		 179 aa  330  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1410  YfaZ family protein  86.59 
 
 		 179 aa  328  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71685  normal  0.181504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2972  YfaZ family protein  86.59 
 
 		 179 aa  328  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.285706  normal  0.104145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3297  YfaZ family protein  58.82 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.842985  decreased coverage  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3446  YfaZ family protein  59.75 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.055004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2962  YfaZ family protein  49.16 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2740  YfaZ family protein  55.97 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000342783  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0027  YfaZ family protein  25.52 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2505  YfaZ family protein  26.58 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2854  YfaZ family protein  26.29 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1319  hypothetical protein  26.29 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0132  YfaZ  27.43 
 
 		 197 aa  47.8  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00180457  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2775  putative outer membrane protein  26.29 
 
 		 180 aa  47.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2689  YfaZ family protein  25 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673529  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2231  YfaZ family protein  26.18 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0687598  normal  0.632442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3277  YfaZ family protein  27.22 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3198  YfaZ family protein  25.97 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3392  YfaZ family protein  27.56 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0581  hypothetical protein  32.41 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000184382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2479  hypothetical protein  25.71 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2534  hypothetical protein  25.71 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2430  putative inner membrane protein  25.71 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2638  putative inner membrane protein  25.71 
 
 		 224 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1117  YfaZ family protein  24.86 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>