122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1402 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2973  YheO domain-containing protein  97.79 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2794  YheO domain-containing protein  96.9 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2877  YheO domain-containing protein  96.46 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3071  YheO domain-containing protein  91.32 
 
 		 219 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3081  YheO domain-containing protein  91.32 
 
 		 219 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3224  YheO domain-containing protein  91.32 
 
 		 219 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1295  YheO domain protein  91.32 
 
 		 219 aa  420  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1208  YheO domain-containing protein  89.33 
 
 		 227 aa  417  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4888  YheO domain-containing protein  80.54 
 
 		 221 aa  377  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002894  putative DNA-binding protein  61.93 
 
 		 219 aa  277  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03080  hypothetical protein  61.93 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2536  MukF protein  61.03 
 
 		 215 aa  271  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0740  putative DNA-binding protein  49.77 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002293  hypothetical protein  44.29 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000331987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0394  YheO domain protein  42.79 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00468087  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00061  hypothetical protein  44.86 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0312  YheO domain protein  41.86 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2767  hypothetical protein  41.44 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000230271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4014  YheO domain protein  40.47 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.182407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3834  YheO domain protein  40.47 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3722  hypothetical protein  39.82 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000194242  normal  0.0632253 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3757  hypothetical protein  39.82 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0543637  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3648  hypothetical protein  39.82 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000508468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3649  hypothetical protein  39.82 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000157298  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3820  hypothetical protein  39.82 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000148293  normal  0.984767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0306  putative DNA-binding protein  41.26 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4555  YheO domain-containing protein  41.2 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495528  normal  0.271247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03197  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.38 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000385535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0367  YheO domain protein  39.38 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615981  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03148  hypothetical protein  39.38 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000388396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3542  hypothetical protein  39.38 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.9543e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3815  hypothetical protein  39.38 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0367  YheO domain-containing protein  39.38 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3627  hypothetical protein  39.38 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000861494  hitchhiker  0.00116448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3720  hypothetical protein  39.38 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4655  hypothetical protein  39.38 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000142414  normal  0.0121567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3763  YheO domain-containing protein  40.91 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000101154  hitchhiker  0.00366713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3925  hypothetical protein  40.93 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000338087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3682  hypothetical protein  40.93 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00382981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0271  YheO domain-containing protein  40.93 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835286  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1636  hypothetical protein  40.83 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2028  YheO domain-containing protein  40.36 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0390581  normal  0.0444206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02785  hypothetical protein  34.88 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0689  YheO domain-containing protein  37.44 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4078  YheO domain-containing protein  33.03 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3043  YheO domain protein  38.39 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3512  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.122215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0107  YheO domain-containing protein  32.57 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0265  YheO domain protein  37.44 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.205654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1492  YheO domain-containing protein  37.04 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1803  YheO domain protein  32.7 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00197351  decreased coverage  0.000758988 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0235  YheO domain protein  30.56 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1772  YheO domain protein  30.48 
 
 		 580 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0420  YheO domain protein  31.88 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0400  YheO domain protein  29.28 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2566  YheO domain protein  30.92 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.086205  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0810  hypothetical protein  31.55 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0541  hypothetical protein  31.73 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0602  YheO domain-containing protein  31.73 
 
 		 210 aa  95.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.156271  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1030  YheO domain-containing protein  31.73 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1367  YheO domain-containing protein  31.94 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0108  YheO domain protein  30.48 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2109  YheO domain-containing protein  29.81 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.763786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20890  YheO domain protein  32.39 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2434  YheO domain protein  31.43 
 
 		 230 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000217954  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0613  YheO domain-containing protein  31.22 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2249  YheO domain protein  27.8 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1820  hypothetical protein  27.71 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0120168  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1578  hypothetical protein  30.2 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1389  hypothetical protein  30.2 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107006  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0263  hypothetical protein  30.58 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2841  YheO domain-containing protein  30.63 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378743 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2761  YheO domain-containing protein  30.7 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0153  YheO domain-containing protein  27.31 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3785  YheO domain-containing protein  26.07 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  0.997739 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0038  YheO domain-containing protein  29.9 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2335  YheO domain protein  28.1 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.579523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2931  YheO domain protein  28.32 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2555  YheO domain protein  26.47 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4178  YheO domain-containing protein  23.27 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0276  helix-turn-helix containing protein  28.57 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1494  hypothetical protein  23.76 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101034  normal  0.19833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3881  YheO domain-containing protein  24.63 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0788485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14000  hypothetical protein  28.43 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234213  normal  0.0113357 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3919  YheO-like  23.65 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0722  YheO domain-containing protein  25.68 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4449  YheO domain-containing protein  23.65 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2654  YheO domain protein  31.28 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5858  YheO domain-containing protein  23.65 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.575899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0739  YheO domain-containing protein  25.68 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.074862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4342  YheO domain-containing protein  24.14 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1241  hypothetical protein  27.94 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2540  YheO domain-containing protein  26.19 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4823  hypothetical protein  24.88 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00729669  normal  0.42509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3568  YheO domain-containing protein  27.7 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634176  normal  0.263492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3937  hypothetical protein  25.62 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0928038  hitchhiker  0.00381937 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0847  YheO domain-containing protein  25.62 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262344  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0364  YheO-like  25.23 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0819  YheO domain-containing protein  25.23 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.229038  normal  0.717767 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>