More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1364 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  100 
 
 		 325 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  84.88 
 
 		 376 aa  578  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  84.57 
 
 		 380 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  83.95 
 
 		 380 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  77.16 
 
 		 371 aa  524  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  70 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  69.6 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  68.79 
 
 		 387 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  66.86 
 
 		 407 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  57.67 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  58.28 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  56.17 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  53.96 
 
 		 367 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  53.21 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  52.92 
 
 		 356 aa  341  9e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  42.77 
 
 		 351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.15 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  40.62 
 
 		 379 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.24 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.1 
 
 		 382 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.98 
 
 		 366 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.67 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.99 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  38.97 
 
 		 381 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  38.97 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  38.97 
 
 		 380 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  40.8 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.8 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.36 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  37.8 
 
 		 379 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.02 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.98 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.14 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  38.37 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  38.37 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  38.37 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  40.18 
 
 		 382 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  38.37 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.76 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.57 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.57 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  39.69 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.06 
 
 		 375 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.23 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  42.59 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  39.64 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  39.64 
 
 		 366 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  41.39 
 
 		 366 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  39.09 
 
 		 365 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.02 
 
 		 385 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  38.2 
 
 		 355 aa  228  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  38.84 
 
 		 358 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  39.94 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.86 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  35.94 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  36.72 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  36.94 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.14 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  35.71 
 
 		 362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  36.61 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  36.92 
 
 		 381 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.56 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  35.98 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.89 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.71 
 
 		 363 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  38.39 
 
 		 353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  34.78 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  34.06 
 
 		 364 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.06 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.37 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  35.6 
 
 		 585 aa  189  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  35 
 
 		 662 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.3 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  34.99 
 
 		 606 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  34.99 
 
 		 606 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.78 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  34.78 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  33.96 
 
 		 605 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  34.78 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.78 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.78 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.78 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.78 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  32.82 
 
 		 627 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  33.64 
 
 		 625 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.78 
 
 		 322 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.95 
 
 		 585 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1389  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  35.71 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.78 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  31.99 
 
 		 605 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.53 
 
 		 669 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.61 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.3 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.54 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.54 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  30.52 
 
 		 373 aa  169  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.23 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  33.23 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.92 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.86 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>