57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1306 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1306  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2969  hypothetical protein  97.35 
 
 		 126 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.092913  unclonable  0.0000376275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3065  hypothetical protein  95.58 
 
 		 126 aa  226  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0335891  decreased coverage  0.0000000160498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2887  hypothetical protein  95.58 
 
 		 126 aa  226  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.884859  hitchhiker  0.00000327359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1125  hypothetical protein  92.92 
 
 		 126 aa  221  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0604212  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3147  hypothetical protein  91.15 
 
 		 126 aa  216  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00243141  normal  0.887855 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1243  hypothetical protein  91.15 
 
 		 126 aa  216  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.442213  normal  0.338722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1210  hypothetical protein  91.15 
 
 		 126 aa  216  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1166  hypothetical protein  91.15 
 
 		 126 aa  216  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.599086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0987  hypothetical protein  81.42 
 
 		 126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.411283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1019  hypothetical protein  81.42 
 
 		 128 aa  190  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00054643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1205  hypothetical protein  76.99 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.069384  hitchhiker  0.000375223 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1097  hypothetical protein  77.88 
 
 		 123 aa  188  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458042  hitchhiker  0.00682906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2974  hypothetical protein  70.8 
 
 		 132 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.534779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2813  hypothetical protein  77.27 
 
 		 128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.215215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0845  hypothetical protein  72.57 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0614  hypothetical protein  51.4 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0293  hypothetical protein  49.52 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000415499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01861  hypothetical protein  49.09 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003821  hypothetical protein  47.32 
 
 		 129 aa  115  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0228492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3246  hypothetical protein  46.15 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1354  hypothetical protein  46.3 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1291  hypothetical protein  42.31 
 
 		 184 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01018  hypothetical protein  42.16 
 
 		 116 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000655555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1760  hypothetical protein  35.58 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1422  hypothetical protein  36.27 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.6699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105576  normal  0.743807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0369  hypothetical protein  34.31 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0352181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0390  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2142  hypothetical protein  32.69 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000913053  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2314  hypothetical protein  35.23 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2317  hypothetical protein  35.23 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000394227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2943  hypothetical protein  32.73 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2592  hypothetical protein  33.71 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000971711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1754  hypothetical protein  33.71 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000786654  hitchhiker  0.00155716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2631  hypothetical protein  33.71 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000548567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2706  hypothetical protein  33.71 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000140382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2460  hypothetical protein  32.95 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000033516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2270  hypothetical protein  32.95 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1991  hypothetical protein  32.95 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2342  hypothetical protein  32.95 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1903  hypothetical protein  33.7 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000176347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2676  hypothetical protein  29.52 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0208691  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1946  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000181986  normal  0.0225511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0395  hypothetical protein  29.13 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2030  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000942918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003401  hypothetical protein  27.59 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000284049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02428  hypothetical protein  24.47 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02381  hypothetical protein  26.74 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2265  hypothetical protein  33.73 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2422  hypothetical protein  29.09 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2142  hypothetical protein  28.92 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000300583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00395  hypothetical protein  27.03 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3876  hypothetical protein  24.07 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1711  hypothetical protein  23.85 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0867  hypothetical protein  22.09 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000349479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1415  hypothetical protein  27.18 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.130351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>