263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1223 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1223  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
330 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1042  phosphoserine phosphatase  90.91 
 
 
330 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  90.61 
 
 
330 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1046  phosphoserine phosphatase  90.91 
 
 
330 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2817  phosphoserine phosphatase SerB  77.58 
 
 
331 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  73.41 
 
 
326 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  73.72 
 
 
326 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  74.02 
 
 
326 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  73.41 
 
 
326 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3544  phosphoserine phosphatase SerB  59.04 
 
 
326 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0084049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1007  phosphoserine phosphatase SerB  58.36 
 
 
328 aa  368  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2810  phosphoserine phosphatase SerB  61.96 
 
 
327 aa  359  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3043  phosphoserine phosphatase SerB  56.21 
 
 
335 aa  358  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0978  phosphoserine phosphatase  72.16 
 
 
316 aa  347  1e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3373  phosphoserine phosphatase  56.52 
 
 
330 aa  343  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1032  phosphoserine phosphatase SerB  57.57 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  60.19 
 
 
306 aa  255  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  59.42 
 
 
322 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  59.42 
 
 
322 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  59.42 
 
 
322 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  59.42 
 
 
322 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  59.42 
 
 
322 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  59.42 
 
 
322 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  59.42 
 
 
322 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  59.42 
 
 
322 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  58.94 
 
 
322 aa  252  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  54.88 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  54.88 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  54.88 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  54.88 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  54.88 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  53.97 
 
 
325 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  58.45 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  57 
 
 
322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  58.45 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 
326 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  53.81 
 
 
325 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  57.49 
 
 
325 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 
325 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  57.97 
 
 
325 aa  238  8e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  56.72 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  55.72 
 
 
326 aa  233  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  54.73 
 
 
328 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  54.63 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  51.22 
 
 
322 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  50.71 
 
 
327 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  51.43 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 
369 aa  202  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  44.84 
 
 
398 aa  199  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  48.06 
 
 
410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  35.84 
 
 
413 aa  189  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 
302 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  37.55 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  35.54 
 
 
404 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 
404 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 
415 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 
404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 
404 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  42.23 
 
 
418 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  42.63 
 
 
429 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 
405 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  44.66 
 
 
410 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 
411 aa  181  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  42.17 
 
 
418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  48.04 
 
 
404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  46.6 
 
 
404 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  46.8 
 
 
432 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  42.23 
 
 
429 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  42.8 
 
 
404 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  47.55 
 
 
411 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1969  phosphoserine phosphatase  47.17 
 
 
240 aa  177  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  47.29 
 
 
419 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  44.17 
 
 
406 aa  175  9e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  41.43 
 
 
404 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  44.17 
 
 
412 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  46.12 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  43.63 
 
 
408 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  52.26 
 
 
327 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  52.26 
 
 
372 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  44.79 
 
 
400 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  45.63 
 
 
405 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  50.26 
 
 
281 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  45.15 
 
 
405 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  45.63 
 
 
405 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  39.42 
 
 
435 aa  169  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  43.52 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  41.56 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  45.15 
 
 
278 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  41.53 
 
 
407 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  43.06 
 
 
298 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  47.29 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  44.61 
 
 
398 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  42.59 
 
 
298 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  46.97 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  48.69 
 
 
281 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  44.44 
 
 
291 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  49.21 
 
 
406 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  43.48 
 
 
291 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  46.97 
 
 
281 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>