292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1053 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  565  1e-160  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  90.78 
 
 		 282 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  90.43 
 
 		 282 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  90.43 
 
 		 282 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  90.07 
 
 		 277 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  53.62 
 
 		 269 aa  248  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  57.01 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  52.49 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  43.72 
 
 		 267 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  41.7 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  35.78 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  44.5 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  37.55 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  42.15 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  35.79 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  41.59 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  38.56 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  37.71 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  37.12 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  44.2 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  38.96 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  37.73 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  36.44 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.52 
 
 		 289 aa  138  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  40.44 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  39.83 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.74 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  36.51 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  37.95 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  40.34 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  37.5 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  38.66 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  40.44 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  35.86 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  35.86 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  37.8 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  38.57 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  35.44 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  41.1 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  38.74 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  36.71 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  38.18 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  41.59 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  37.82 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  35.44 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  35.59 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  31.95 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  34.02 
 
 		 279 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  34.21 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  43.38 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  30.08 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  34.85 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  33.47 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  35.95 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  31.6 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  32.63 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  32.68 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  33.78 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  35.1 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.84 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.3 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  33.86 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  29.92 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  31.67 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  33.05 
 
 		 252 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  29.55 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  33.05 
 
 		 252 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  33.05 
 
 		 252 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  33.04 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  31.25 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  33.75 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  33.48 
 
 		 276 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  32.59 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  32.59 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  32.59 
 
 		 286 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  32.76 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  33.19 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  33.77 
 
 		 276 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.48 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.48 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.91 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  31.7 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  31.65 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  31.15 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1447  PEP phosphonomutase and related enzymes  31.3 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  31.97 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  34.31 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  29.58 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  31.53 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  31.47 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  30.84 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  29.06 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  31.11 
 
 		 267 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  30.53 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  30.45 
 
 		 286 aa  89  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  31.06 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  30.22 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.47 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  33.19 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>