More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0959 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  96.28 
 
 		 511 aa  1008    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  91.76 
 
 		 510 aa  967    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  100 
 
 		 511 aa  1040    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  91.76 
 
 		 510 aa  967    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  91.18 
 
 		 510 aa  962    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  90.61 
 
 		 518 aa  958    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  91.57 
 
 		 510 aa  965    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  96.48 
 
 		 511 aa  1010    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  96.48 
 
 		 511 aa  1010    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  58.13 
 
 		 508 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  54.78 
 
 		 515 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0388  leucyl aminopeptidase  56.59 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00389759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  42.57 
 
 		 497 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  43.95 
 
 		 500 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  41.11 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  42.54 
 
 		 500 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  43.05 
 
 		 499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  41.33 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  43.94 
 
 		 495 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  42.09 
 
 		 500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  41.56 
 
 		 500 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  40.73 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  41.42 
 
 		 496 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  42.05 
 
 		 499 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  43.3 
 
 		 497 aa  329  7e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  43.3 
 
 		 497 aa  329  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  42.79 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  40.87 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  41.18 
 
 		 500 aa  325  8.000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  41.19 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  41.05 
 
 		 497 aa  323  7e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  41.53 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  41.32 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  41.58 
 
 		 497 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  41.44 
 
 		 497 aa  312  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  39.66 
 
 		 503 aa  312  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  38.09 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  41.36 
 
 		 514 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  37.33 
 
 		 506 aa  309  1.0000000000000001e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  38.76 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  38.12 
 
 		 542 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  43.65 
 
 		 539 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  41.36 
 
 		 488 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  38.78 
 
 		 500 aa  301  1e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  39.28 
 
 		 500 aa  301  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  37.81 
 
 		 500 aa  301  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  39.87 
 
 		 489 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  41.14 
 
 		 489 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  37.94 
 
 		 494 aa  293  5e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  36.6 
 
 		 493 aa  292  9e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  39.55 
 
 		 503 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  39.37 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  39.35 
 
 		 503 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  41.99 
 
 		 481 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  37.39 
 
 		 493 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  39.55 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  39.35 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  39.55 
 
 		 503 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  40.33 
 
 		 503 aa  286  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  40.86 
 
 		 503 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1505  leucyl aminopeptidase  41.01 
 
 		 503 aa  286  9e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000443927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  40.52 
 
 		 501 aa  285  9e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  40.86 
 
 		 503 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  40.66 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  39.76 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  39.19 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  39.76 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  37.43 
 
 		 493 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15321  leucyl aminopeptidase  40.13 
 
 		 490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  39.24 
 
 		 491 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1430  leucyl aminopeptidase  39.64 
 
 		 490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  42.42 
 
 		 488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  40.66 
 
 		 503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  40.66 
 
 		 503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  40.66 
 
 		 503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  39.29 
 
 		 500 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  40.66 
 
 		 503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  38.46 
 
 		 511 aa  283  7.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2730  Leucyl aminopeptidase  40.09 
 
 		 511 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.387562  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0069  leucyl aminopeptidase  37.42 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  39.66 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  41.28 
 
 		 496 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15181  leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 		 490 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  38.51 
 
 		 496 aa  280  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  36.02 
 
 		 488 aa  279  9e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14931  leucyl aminopeptidase  37.86 
 
 		 495 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0623  leucyl aminopeptidase  40.8 
 
 		 536 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022147  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1233  Leucyl aminopeptidase  40.04 
 
 		 536 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  39.35 
 
 		 497 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  37.34 
 
 		 493 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  39.43 
 
 		 506 aa  277  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  37.81 
 
 		 495 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  38.6 
 
 		 508 aa  277  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  44.23 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1500  Leucyl aminopeptidase  35.49 
 
 		 482 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2408  PepA aminopeptidase  39.43 
 
 		 507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.729851  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  39.69 
 
 		 496 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2727  leucyl aminopeptidase  39.46 
 
 		 491 aa  274  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2684  hypothetical protein  44.05 
 
 		 483 aa  273  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2556  hypothetical protein  44.05 
 
 		 483 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>