More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0922 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  100 
 
 		 424 aa  845    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  85.31 
 
 		 449 aa  717    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  86.73 
 
 		 444 aa  721    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  86.44 
 
 		 432 aa  724    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  86.26 
 
 		 444 aa  717    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  86.26 
 
 		 444 aa  716    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  97.61 
 
 		 435 aa  817    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  97.64 
 
 		 440 aa  826    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  97.64 
 
 		 440 aa  827    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  84.5 
 
 		 430 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  95.22 
 
 		 443 aa  797    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  86.73 
 
 		 444 aa  721    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  85.47 
 
 		 433 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  66.58 
 
 		 409 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  57.71 
 
 		 410 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  59.35 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  48.9 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  47.1 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  46.35 
 
 		 434 aa  375  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  47.15 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  47.67 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  47.15 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  47.67 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  47.75 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  47.54 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  48.18 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  48.51 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  48.27 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  47.54 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  47.94 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  48.18 
 
 		 417 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  49.24 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  47.04 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  49.6 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.19 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  46.8 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  46.55 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  46.06 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  46.8 
 
 		 437 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  46.8 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  46.55 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  46.8 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  46.31 
 
 		 440 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  46.56 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  46.68 
 
 		 434 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  46.92 
 
 		 434 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  46.47 
 
 		 433 aa  362  6e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  48.88 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  45.32 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  45.61 
 
 		 409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  47.67 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  45.81 
 
 		 441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  44.33 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  43.95 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  47.5 
 
 		 416 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  44.05 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  44.34 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  47.22 
 
 		 411 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  46.97 
 
 		 411 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  46.97 
 
 		 411 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  46.97 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.73 
 
 		 411 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  46.73 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  46.73 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  46.73 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  46.73 
 
 		 411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  46.73 
 
 		 411 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  44.65 
 
 		 448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  44.97 
 
 		 413 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  45.77 
 
 		 438 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  44.84 
 
 		 411 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  44.65 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  40.61 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  42.69 
 
 		 430 aa  323  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  42.05 
 
 		 457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  45.23 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  41.81 
 
 		 457 aa  320  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  45.55 
 
 		 437 aa  319  7e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  42.46 
 
 		 445 aa  316  5e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0646  Na+/H+ - glutamate/aspartate symport protein  41.07 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0510  sodium:dicarboxylate symporter  40.63 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.249513  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  41.52 
 
 		 445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  41.18 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0983  sodium:dicarboxylate symporter  40.86 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  42.07 
 
 		 409 aa  299  5e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  40.1 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0148  sodium:dicarboxylate symporter  39.6 
 
 		 416 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.319254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1555  proton/glutamate symporter family protein  41.23 
 
 		 423 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0144  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0142  sodium:dicarboxylate symporter  40.15 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1116  sodium:dicarboxylate symporter  39.85 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.400391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0147  sodium:dicarboxylate symporter  40 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4211  sodium:dicarboxylate symporter  39.6 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  41.38 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  41.38 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  41.38 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  41.13 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1593  proton/glutamate symporter family protein  41.88 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000481335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  41.13 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  41.13 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>