130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0877 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0877  acetyltransferase  100 
 
 
169 aa  352  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3487  GCN5-related N-acetyltransferase  92.12 
 
 
174 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0875  GCN5-related N-acetyltransferase  91.52 
 
 
169 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183729  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  92.12 
 
 
168 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.623177  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0887  GCN5-related N-acetyltransferase  89.09 
 
 
173 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0061391  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3125  GCN5-related N-acetyltransferase  85.21 
 
 
180 aa  280  9e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  78.18 
 
 
170 aa  276  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  78.18 
 
 
170 aa  273  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  77.58 
 
 
169 aa  269  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.881941  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2975  acetyltransferase  53.25 
 
 
164 aa  161  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  44.79 
 
 
159 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0137231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
161 aa  124  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  37.72 
 
 
165 aa  124  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  39.63 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
177 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2016  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000283467  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3423  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.679599  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2130  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0578  GCN5-related N-acetyltransferase  44.62 
 
 
72 aa  60.8  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.573636  normal  0.133942 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0006  hypothetical protein  31.95 
 
 
213 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107828 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  31.62 
 
 
164 aa  57.4  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3075  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.882795  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3070  acetyltransferase, GNAT family  28.1 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7229  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
147 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  34.48 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  26.51 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1139  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.59 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6333  acetyltransferase  29.32 
 
 
156 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  29.69 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
160 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0123  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
139 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  24.12 
 
 
200 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
169 aa  47.8  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.307283  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  48.33 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
180 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  22.29 
 
 
180 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0555  acetyltransferase  26.04 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0497  acetyltransferase, GNAT  26.04 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0587  acetyltransferase  26.04 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0105  acetyltransferase  34.15 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0643  acetyltransferase, GNAT family  26.04 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6702  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.869276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0109  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
202 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4712  acetyltransferase, GNAT family  25.44 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0611  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0625  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  28.47 
 
 
177 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0499  acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4037  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0653  acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  31.75 
 
 
298 aa  44.7  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1580  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
145 aa  44.7  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  27.34 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5655  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0802774  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2958  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0822449  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
291 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0714  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
381 aa  44.3  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2643  acetyltransferase  30.2 
 
 
135 aa  44.3  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  29.41 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1482  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000139718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.326397  normal  0.640285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6642  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
154 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193882  normal  0.0657736 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7217  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370692  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  30.94 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  31.11 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51560  acetyltransferase  25.97 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.44093e-17  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  31.11 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  37.29 
 
 
290 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2662  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.362327  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1605  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.735918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003788  transcriptional regulator  28.83 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00106887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6226  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0286732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  34.15 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0220  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  29.45 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  29.45 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  29.45 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
155 aa  42  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
182 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.972339  normal  0.281853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>