55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0865 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  967    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  79.88 
 
 		 496 aa  757    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  79.68 
 
 		 496 aa  755    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  79.48 
 
 		 496 aa  754    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  76.1 
 
 		 496 aa  745    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  78.09 
 
 		 496 aa  751    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  89.24 
 
 		 502 aa  881    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  89.24 
 
 		 502 aa  882    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  56.05 
 
 		 503 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  57.77 
 
 		 500 aa  512  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  55.47 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  41.43 
 
 		 451 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  36.72 
 
 		 483 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  30.38 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  29.88 
 
 		 627 aa  87.4  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  30.68 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  29.02 
 
 		 481 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  28.51 
 
 		 498 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  27.37 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  28.14 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  27.44 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  36.9 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  28.78 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  33.99 
 
 		 183 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  29.84 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  33.57 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  24.68 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  27.7 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  38.64 
 
 		 144 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  30.47 
 
 		 190 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  26.67 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  31.4 
 
 		 139 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  30.84 
 
 		 139 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  30.84 
 
 		 139 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  40 
 
 		 139 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  40 
 
 		 139 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  40 
 
 		 139 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  40 
 
 		 139 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.87 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  33.91 
 
 		 156 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  33.91 
 
 		 142 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  38.82 
 
 		 139 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  31.63 
 
 		 214 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  33.04 
 
 		 157 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  33.04 
 
 		 157 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  37.25 
 
 		 143 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1274  hypothetical protein  36.45 
 
 		 163 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  26 
 
 		 241 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  29.66 
 
 		 154 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  33.94 
 
 		 178 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  30.77 
 
 		 151 aa  44.3  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  29.52 
 
 		 281 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  28.33 
 
 		 183 aa  43.9  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  36.8 
 
 		 139 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  32.17 
 
 		 157 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>