More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0761 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  99.11 
 
 		 112 aa  221  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  99.11 
 
 		 112 aa  221  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  99.11 
 
 		 112 aa  221  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  98.21 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  98.21 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  98.21 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  97.32 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  98.21 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  94.64 
 
 		 112 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  90.18 
 
 		 112 aa  204  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  201  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  200  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  88.39 
 
 		 112 aa  200  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  87.5 
 
 		 112 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 121 aa  192  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  83.93 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  79.46 
 
 		 112 aa  187  5e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  183  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  181  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  75.89 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  75.89 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  75 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  69.64 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 136 aa  168  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 116 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 116 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  69.64 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 		 112 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  71.43 
 
 		 112 aa  163  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  71.43 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3251  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0494  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  67.86 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3165  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>