219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0630 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 668 aa  1382    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  62.05 
 
 		 662 aa  838    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  63.4 
 
 		 663 aa  871    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  60.92 
 
 		 667 aa  865    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  89.82 
 
 		 668 aa  1264    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  90.12 
 
 		 668 aa  1268    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  61.8 
 
 		 661 aa  834    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  39.53 
 
 		 688 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  39.37 
 
 		 688 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  39.57 
 
 		 688 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  38.88 
 
 		 686 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  39.23 
 
 		 688 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  38.69 
 
 		 725 aa  432  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  39.06 
 
 		 698 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  39.64 
 
 		 710 aa  425  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  38.62 
 
 		 726 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  36.55 
 
 		 687 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  39.12 
 
 		 723 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  38.21 
 
 		 745 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  39.44 
 
 		 753 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  39.12 
 
 		 719 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  38.94 
 
 		 667 aa  415  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  38.21 
 
 		 745 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  38.21 
 
 		 745 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  38.14 
 
 		 749 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  38.06 
 
 		 745 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  38.65 
 
 		 749 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  36.62 
 
 		 684 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  36.66 
 
 		 676 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  35.77 
 
 		 724 aa  405  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  38.44 
 
 		 687 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  38.74 
 
 		 709 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  36.51 
 
 		 676 aa  402  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  36.99 
 
 		 713 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  36.88 
 
 		 681 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  36.88 
 
 		 681 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  36.6 
 
 		 710 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  37.19 
 
 		 686 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  36.35 
 
 		 669 aa  385  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  36.17 
 
 		 710 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  36.17 
 
 		 710 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  36.17 
 
 		 710 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  34.69 
 
 		 691 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.3 
 
 		 665 aa  265  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  30.91 
 
 		 695 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  85.59 
 
 		 185 aa  220  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 672 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 697 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 699 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 681 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 668 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 760 aa  135  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 661 aa  126  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 696 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.93 
 
 		 699 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 685 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 702 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 702 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 702 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.09 
 
 		 698 aa  100  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  24.36 
 
 		 708 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 713 aa  100  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 673 aa  99.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 713 aa  92.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  38.65 
 
 		 768 aa  88.6  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 684 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  22 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0074  heme receptor HutR  22.83 
 
 		 713 aa  79  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0136209  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  23.72 
 
 		 656 aa  77.4  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 716 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 705 aa  75.1  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  25.96 
 
 		 625 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  27.65 
 
 		 712 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0435  TonB-dependent receptor domain-containing protein  23.55 
 
 		 596 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  21.98 
 
 		 780 aa  72  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  23.08 
 
 		 650 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 708 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  22.74 
 
 		 628 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05130  hypothetical protein  26.98 
 
 		 248 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 713 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 713 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 713 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  21.75 
 
 		 659 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  21.63 
 
 		 641 aa  67.4  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  22.78 
 
 		 650 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  22.67 
 
 		 650 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  21.63 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 749 aa  65.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.58 
 
 		 775 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  21.63 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  21.63 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  21.63 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  21.63 
 
 		 663 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.8 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  21.63 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  22.63 
 
 		 650 aa  65.1  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 729 aa  63.9  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 766 aa  63.9  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>