More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0558 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0558  smtA protein  100 
 
 		 260 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  93.44 
 
 		 261 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  93.39 
 
 		 262 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  93.39 
 
 		 262 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  86.77 
 
 		 257 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  87.16 
 
 		 257 aa  471  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  86.77 
 
 		 257 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  85.99 
 
 		 257 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  84.82 
 
 		 257 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  70.59 
 
 		 256 aa  401  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  73.23 
 
 		 254 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  67.06 
 
 		 284 aa  357  9e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  63.39 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  44.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  44.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  44.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  44.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  44.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  44.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  44.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  44.98 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  44.18 
 
 		 267 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  44.18 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  44.18 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  44.18 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  44.18 
 
 		 267 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  43.82 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  46.09 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  44.22 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  40.77 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  42.58 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  40.64 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  41.83 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  41.83 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  41.83 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  41.04 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  39.44 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  38.49 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  40.56 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  39.04 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  40 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  40.77 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  36.8 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  40 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  39.53 
 
 		 249 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  37.4 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  40.39 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  39.53 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  40.55 
 
 		 249 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  38.1 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  37.7 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  38.58 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  34.65 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  40 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  39 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  36.02 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  35.24 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  34.83 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  29.22 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  28.14 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  32.68 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  30.67 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  29.37 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.07 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.29 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.47 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.4 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2534  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.9 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.19 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.66 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  24.63 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.46 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.45 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.58 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.83 
 
 		 391 aa  55.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  29.31 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.64 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  33.05 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.64 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>