34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0501 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  24.88 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  24.88 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  24.53 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  27.75 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  27.17 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  24.09 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  26.01 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  25.64 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  27.65 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  23.56 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  23.7 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  26.18 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  20 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  24.41 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  21.76 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  25.54 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  22.97 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  20.43 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  21.2 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  22.4 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  23.08 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  20.28 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  20.28 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  22.94 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  20.28 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  20.28 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  20.28 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  20.28 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  20.28 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  20.28 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  25.15 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  24.24 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  21.2 
 
 		 222 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>