218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0492 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  100 
 
 
209 aa  437  1e-122  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  95.69 
 
 
208 aa  417  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  94.74 
 
 
208 aa  414  1e-115  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  91.87 
 
 
209 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  94.26 
 
 
208 aa  411  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  91.87 
 
 
209 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  91.87 
 
 
209 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  91.39 
 
 
209 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  90.91 
 
 
209 aa  407  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  91.18 
 
 
210 aa  399  1e-110  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  83.73 
 
 
209 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  76.81 
 
 
212 aa  342  3e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  75.12 
 
 
209 aa  334  7e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  72.64 
 
 
207 aa  313  1e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  65.33 
 
 
205 aa  267  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  61.76 
 
 
209 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  61.19 
 
 
202 aa  262  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  1.16177e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  62.69 
 
 
208 aa  261  5e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  61.69 
 
 
206 aa  258  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  60.4 
 
 
201 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  60.7 
 
 
230 aa  255  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.69 
 
 
209 aa  254  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  58.65 
 
 
207 aa  254  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  61.81 
 
 
207 aa  251  4e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  58.54 
 
 
205 aa  252  4e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  61.81 
 
 
207 aa  251  4e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  59.7 
 
 
201 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  60.3 
 
 
205 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  59.7 
 
 
201 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  59.3 
 
 
205 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  58.17 
 
 
208 aa  247  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  58.25 
 
 
218 aa  247  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  57.97 
 
 
209 aa  247  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  58.17 
 
 
208 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  60.3 
 
 
205 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  58.17 
 
 
208 aa  245  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  58.17 
 
 
221 aa  244  5e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  59.2 
 
 
201 aa  244  5e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  58.21 
 
 
209 aa  243  1e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  57.69 
 
 
208 aa  243  1e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  56.25 
 
 
207 aa  243  1e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  57.71 
 
 
206 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  56.78 
 
 
210 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  57.79 
 
 
206 aa  232  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  51.2 
 
 
208 aa  222  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  53.92 
 
 
209 aa  221  5e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  52.66 
 
 
216 aa  214  1e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  54.19 
 
 
203 aa  211  6e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  52.68 
 
 
205 aa  211  6e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  50.5 
 
 
221 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  49.26 
 
 
184 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  46.15 
 
 
207 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  51.1 
 
 
202 aa  183  2e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  65.62 
 
 
140 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.7 
 
 
200 aa  174  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  44.39 
 
 
202 aa  171  6e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.35 
 
 
203 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  43.28 
 
 
203 aa  165  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  46.41 
 
 
203 aa  164  7e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  43.54 
 
 
203 aa  164  1e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.41 
 
 
209 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  42.79 
 
 
203 aa  162  4e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  41.15 
 
 
208 aa  162  5e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  43.78 
 
 
201 aa  162  5e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  43.78 
 
 
201 aa  162  5e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  44.27 
 
 
201 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  41.09 
 
 
201 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  43.54 
 
 
201 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  44.75 
 
 
194 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  43.27 
 
 
201 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  43.65 
 
 
194 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  43.65 
 
 
194 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  42.58 
 
 
201 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  40.91 
 
 
209 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  44.51 
 
 
212 aa  148  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  41.8 
 
 
241 aa  145  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  38.74 
 
 
230 aa  134  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  38.74 
 
 
230 aa  134  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  38.35 
 
 
209 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  42.37 
 
 
220 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  37.7 
 
 
229 aa  130  2e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  35.27 
 
 
218 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  36.36 
 
 
218 aa  121  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  34.38 
 
 
211 aa  119  5e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  34.34 
 
 
292 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  34.88 
 
 
203 aa  110  2e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.02 
 
 
219 aa  110  2e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  35.71 
 
 
203 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  40.94 
 
 
216 aa  108  4e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  32.64 
 
 
204 aa  109  4e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.22 
 
 
197 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.08 
 
 
216 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  36.27 
 
 
287 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2164  hypothetical protein  37.7 
 
 
200 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  35.57 
 
 
203 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  35.5 
 
 
200 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.93 
 
 
199 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.32 
 
 
206 aa  104  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  34.45 
 
 
228 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.17 
 
 
294 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>