279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0379 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  487  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  56.6 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  58.37 
 
 		 238 aa  287  8e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  56.84 
 
 		 244 aa  287  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  61.37 
 
 		 235 aa  285  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  41.41 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  35.65 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  38.43 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  37.83 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  36.36 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  39.44 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  34.87 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  39.22 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  36.65 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  34.39 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  38.19 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  35.32 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  37.98 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  35.94 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  35.94 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  33.03 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  38.25 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  33.94 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  33.49 
 
 		 224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  32.88 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  36.53 
 
 		 238 aa  134  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  35.65 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  34.53 
 
 		 224 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  29.63 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  30.9 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  32.46 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  34.1 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0505  hypothetical protein  35.14 
 
 		 233 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722938 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  30.2 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  37.39 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  33.64 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  33.78 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  33.49 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  33.49 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  30.8 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  33.78 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  30.8 
 
 		 303 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  30.38 
 
 		 316 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  30.38 
 
 		 295 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  30.38 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  30.38 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0309  zinc metalloprotease  31.88 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0384  zinc metalloprotease  31.4 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0625718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0317  hypothetical protein  31.88 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0306  zinc metalloprotease  30.92 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  30.53 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  30.21 
 
 		 265 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0431  hypothetical protein  30.43 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00811962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  31.4 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  31.4 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  30.92 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0431  hypothetical protein  30.92 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  28.27 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  28.27 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  28.27 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  28.27 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  28.27 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  28.27 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  28.27 
 
 		 292 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  30.84 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  28.7 
 
 		 285 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  27.6 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  27.6 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  28.7 
 
 		 288 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  29.69 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  30.97 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  30.73 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  27.51 
 
 		 300 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  32.08 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  28.19 
 
 		 300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  30.59 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  32.65 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  34.78 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  31.67 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  28.22 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  31.67 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  29.49 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  29.6 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  34.76 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  29.82 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  30.32 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  32.73 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  27.78 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  35.87 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  25.57 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  26.15 
 
 		 286 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  29.3 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  32.73 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  28.1 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  33.81 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  28.96 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  27.39 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  28.22 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3676  hypothetical protein  30.17 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>