109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0348 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0348  putative acyltransferase  100 
 
 
300 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3625  putative acyltransferase  93.67 
 
 
300 aa  587  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0319  putative acyltransferase  93.67 
 
 
300 aa  587  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3821  putative acyltransferase  91.33 
 
 
297 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3941  putative acyltransferase  87.92 
 
 
298 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4017  putative acyltransferase  87.67 
 
 
300 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4043  putative acyltransferase  87.33 
 
 
300 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3640  putative acyltransferase  88.93 
 
 
298 aa  559  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4136  putative acyltransferase  87.92 
 
 
298 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0282  putative acyltransferase  72.45 
 
 
294 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.028108 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4173  putative acyltransferase  71.72 
 
 
302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0330  putative acyltransferase  72.73 
 
 
301 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0409  putative acyltransferase  71.67 
 
 
301 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0417  putative acyltransferase  70.61 
 
 
298 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3290  putative acyltransferase  69.67 
 
 
306 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3422  putative acyltransferase  70.31 
 
 
299 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4055  putative acyltransferase  58.53 
 
 
300 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0029965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03628  putative acyltransferase  56.08 
 
 
304 aa  353  1e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2870  putative acyltransferase  53.4 
 
 
301 aa  332  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  hitchhiker  0.00487826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4830  putative acyltransferase  52.72 
 
 
303 aa  331  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1162  putative acyltransferase  50.68 
 
 
300 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.389136  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02093  putative acyltransferase  49.66 
 
 
300 aa  294  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2503  putative acyltransferase  49.66 
 
 
303 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2109  putative acyltransferase  49.66 
 
 
303 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4920  putative acyltransferase  50.72 
 
 
300 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1997  putative acyltransferase  47.4 
 
 
304 aa  290  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3794  putative acyltransferase  45.89 
 
 
317 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3646  putative acyltransferase  48.01 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1168  acyltransferase family protein  46.96 
 
 
307 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2744  putative acyltransferase  49.1 
 
 
305 aa  279  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.244294  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1006  putative acyltransferase  46.96 
 
 
301 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4686  putative acyltransferase  47.55 
 
 
304 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53490  putative acyltransferase  47.55 
 
 
304 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2692  putative acyltransferase  46.76 
 
 
299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0844158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0879  putative acyltransferase  48.88 
 
 
300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5198  putative acyltransferase  47.4 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0355  putative acyltransferase  46.86 
 
 
295 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4244  putative acyltransferase  44.17 
 
 
318 aa  265  8e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00468249  normal  0.164529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0332  putative acyltransferase  46.49 
 
 
295 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244482  normal  0.228044 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5303  putative acyltransferase  43.82 
 
 
318 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000210001  normal  0.689009 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4086  putative acyltransferase  43.82 
 
 
301 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4380  putative acyltransferase  43.82 
 
 
301 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03748  predicted endonuclease  44.6 
 
 
310 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.02108  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4335  putative acyltransferase  43.82 
 
 
301 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0165899  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03697  hypothetical protein  44.6 
 
 
310 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0194734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4724  putative acyltransferase  50.4 
 
 
307 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4873  putative acyltransferase  46.86 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.489512  normal  0.226385 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4124  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.24 
 
 
310 aa  262  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00625279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4153  putative acyltransferase  44.24 
 
 
310 aa  262  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00244028  hitchhiker  0.0000165224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0452  acyltransferase family protein  45.86 
 
 
299 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.621143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06030  putative acyltransferase  48.51 
 
 
295 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.015465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0566  putative acyltransferase  48.51 
 
 
295 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0358  putative acyltransferase  45.76 
 
 
295 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34735  normal  0.269668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0950  putative acyltransferase  43.9 
 
 
297 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0920  putative acyltransferase  43.55 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4044  putative acyltransferase  45.85 
 
 
314 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3942  putative acyltransferase  45.29 
 
 
314 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4125  putative acyltransferase  46.77 
 
 
296 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4137  putative acyltransferase  45.29 
 
 
314 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4888  putative acyltransferase  43 
 
 
296 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514103  hitchhiker  0.000000684246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0347  putative acyltransferase  43.01 
 
 
302 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0329  putative acyltransferase  44.17 
 
 
316 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4018  putative acyltransferase  45.13 
 
 
314 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4056  putative acyltransferase  44.15 
 
 
298 aa  248  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0720932  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0281  putative acyltransferase  42.4 
 
 
315 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0103155 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3822  putative acyltransferase  44.04 
 
 
313 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1456  putative acyltransferase  42.71 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0318  putative acyltransferase  43.32 
 
 
313 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3626  putative acyltransferase  43.68 
 
 
313 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3641  putative acyltransferase  43.8 
 
 
314 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4279  putative acyltransferase  41.22 
 
 
302 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4325  putative acyltransferase  41.22 
 
 
302 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4208  putative acyltransferase  39.93 
 
 
302 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4386  putative acyltransferase  41.22 
 
 
302 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0215545  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4174  putative acyltransferase  43 
 
 
306 aa  240  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4229  putative acyltransferase  41.22 
 
 
302 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000366045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2486  putative acyltransferase  41.3 
 
 
294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.400705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3291  putative acyltransferase  41.94 
 
 
313 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2169  putative acyltransferase  39.1 
 
 
300 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.141327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0012  putative acyltransferase  39.1 
 
 
300 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3423  putative acyltransferase  42.72 
 
 
313 aa  235  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00406  putative acyltransferase  41.92 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05860  putative acyltransferase  43.27 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1819  putative acyltransferase  41.52 
 
 
305 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0991283  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002044  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  41.67 
 
 
292 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0416  putative acyltransferase  40.94 
 
 
301 aa  228  9e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0148  putative acyltransferase  39.73 
 
 
296 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.28872  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0408  putative acyltransferase  43.48 
 
 
307 aa  225  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2177  putative acyltransferase  39.38 
 
 
296 aa  223  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000219754  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2088  putative acyltransferase  43.09 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1105  putative acyltransferase  36.9 
 
 
320 aa  209  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0819503 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1316  putative acyltransferase  36.9 
 
 
320 aa  209  4e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03629  putative acyltransferase  40.78 
 
 
297 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0043  putative acyltransferase  37.59 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2147  putative acyltransferase  37.23 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0632358  normal  0.568225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3557  putative acyltransferase  33.45 
 
 
326 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.554768  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0363  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.68 
 
 
234 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000581696  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3116  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  29.61 
 
 
234 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02990  acyltransferase, putative  27.03 
 
 
419 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.435326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2708  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.4 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>