51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0152 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  100 
 
 
627 aa  1288    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  71.88 
 
 
612 aa  921    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  74.49 
 
 
615 aa  923    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  89.83 
 
 
683 aa  1125    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  89.83 
 
 
683 aa  1123    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  86.06 
 
 
663 aa  1116    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  70.83 
 
 
627 aa  909    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  72.5 
 
 
613 aa  910    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  89.83 
 
 
684 aa  1128    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  89.83 
 
 
683 aa  1125    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  70.26 
 
 
610 aa  879    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  92.6 
 
 
659 aa  1192    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  68.74 
 
 
619 aa  877    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  92.69 
 
 
665 aa  1176    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  93.3 
 
 
658 aa  1176    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.81 
 
 
631 aa  592  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.95 
 
 
609 aa  534  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  39.94 
 
 
634 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.78 
 
 
634 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  35.47 
 
 
592 aa  332  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.36 
 
 
581 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.03 
 
 
581 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.64 
 
 
581 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.22 
 
 
580 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  30 
 
 
570 aa  269  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  28.87 
 
 
576 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.39 
 
 
577 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.4 
 
 
580 aa  243  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  28.24 
 
 
575 aa  237  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.24 
 
 
526 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  23.86 
 
 
484 aa  143  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.72 
 
 
599 aa  100  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.08 
 
 
606 aa  91.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.08 
 
 
606 aa  91.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.64 
 
 
615 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.49 
 
 
618 aa  89.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  20.79 
 
 
541 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.28 
 
 
506 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.64 
 
 
557 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  25 
 
 
361 aa  50.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.06 
 
 
585 aa  49.3  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  20.37 
 
 
906 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5924  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.5 
 
 
837 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163745  normal  0.580965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01020  Conserved secreted Zn-dependent enzyme from deacylase/carboxypeptidase superfamily protein  25.81 
 
 
823 aa  47.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.150102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  23.15 
 
 
840 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.19 
 
 
553 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.36 
 
 
862 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.56 
 
 
568 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.03 
 
 
375 aa  44.7  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0915  hypothetical protein  21.88 
 
 
923 aa  44.7  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0079  hypothetical protein  21.78 
 
 
816 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>