15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0074 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0074  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  851    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0077  hypothetical protein  78.67 
 
 
436 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0075  hypothetical protein  78.44 
 
 
436 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0079  hypothetical protein  78.9 
 
 
436 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4275  hypothetical protein  63.13 
 
 
436 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0074  hypothetical protein  62.9 
 
 
436 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0079  hypothetical protein  63.13 
 
 
436 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0076  hypothetical protein  62.67 
 
 
436 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0060  hypothetical protein  62.85 
 
 
438 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3974  hypothetical protein  43.17 
 
 
430 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4861  hypothetical protein  43.17 
 
 
428 aa  302  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3777  hypothetical protein  43.94 
 
 
420 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4187  hypothetical protein  39.59 
 
 
434 aa  259  8e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0071  hypothetical protein  33.03 
 
 
438 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3572  hypothetical protein  31.66 
 
 
413 aa  137  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>