279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0024 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  68.31 
 
 		 483 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  63.17 
 
 		 483 aa  661    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  100 
 
 		 486 aa  977    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  82.92 
 
 		 485 aa  805    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  94.03 
 
 		 485 aa  879    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  92.18 
 
 		 485 aa  862    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  82.1 
 
 		 485 aa  804    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  92.18 
 
 		 485 aa  862    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  82.92 
 
 		 485 aa  788    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  82.27 
 
 		 485 aa  805    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  82.1 
 
 		 485 aa  784    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  94.03 
 
 		 485 aa  878    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000191681  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  94.24 
 
 		 485 aa  879    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  81.28 
 
 		 485 aa  794    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  94.03 
 
 		 485 aa  878    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  88.66 
 
 		 485 aa  849    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  92.18 
 
 		 485 aa  862    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000299675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  92.18 
 
 		 485 aa  862    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  68.72 
 
 		 485 aa  633  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000177354  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  68.93 
 
 		 485 aa  628  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  65.64 
 
 		 483 aa  628  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  68.93 
 
 		 485 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  66.05 
 
 		 483 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000196268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  65.43 
 
 		 483 aa  627  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  66.05 
 
 		 483 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  66.26 
 
 		 483 aa  626  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  66.05 
 
 		 483 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  66.05 
 
 		 483 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  66.05 
 
 		 483 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  65.43 
 
 		 483 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  63.14 
 
 		 488 aa  627  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  65.43 
 
 		 483 aa  624  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  69.14 
 
 		 485 aa  621  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  64.61 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  64.61 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000031848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  64.61 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000758223  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  64.61 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  64.61 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  64.61 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000419761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  64.61 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  0.00000337879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  64.61 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000116067  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  64.61 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  66.46 
 
 		 483 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  66.46 
 
 		 483 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018042  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  66.67 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000159691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  66.67 
 
 		 483 aa  610  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000278342  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  61.73 
 
 		 483 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  58.64 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  59.18 
 
 		 483 aa  569  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  57.82 
 
 		 483 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  55.33 
 
 		 483 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  57.17 
 
 		 483 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  57.11 
 
 		 482 aa  532  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  54.43 
 
 		 482 aa  527  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  55.26 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  50.62 
 
 		 481 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  50.41 
 
 		 487 aa  471  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  48.84 
 
 		 483 aa  458  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  48.73 
 
 		 488 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  45.49 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  45.04 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  41.86 
 
 		 486 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  42.27 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  43.07 
 
 		 474 aa  398  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  40.95 
 
 		 486 aa  396  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  44.17 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  44.49 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  41.98 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  41.39 
 
 		 488 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  43.72 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  40 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  40.57 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  40.37 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40.66 
 
 		 479 aa  365  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  43.76 
 
 		 481 aa  362  6e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  43.01 
 
 		 485 aa  362  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  41.72 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  42.39 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  40.94 
 
 		 482 aa  344  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  38.49 
 
 		 479 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  42.98 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  40.78 
 
 		 483 aa  333  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  37.58 
 
 		 478 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40.57 
 
 		 476 aa  330  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  40.21 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  37.34 
 
 		 466 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  39.46 
 
 		 483 aa  319  7e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.93 
 
 		 491 aa  312  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  39.55 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  38.28 
 
 		 498 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  40.37 
 
 		 480 aa  307  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  39.22 
 
 		 486 aa  302  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  36.27 
 
 		 481 aa  302  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  38.09 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  36.62 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  35.86 
 
 		 481 aa  296  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  37.79 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  36.53 
 
 		 482 aa  296  7e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  37.87 
 
 		 484 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  37.87 
 
 		 484 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>