More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0168 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  100 
 
 		 144 aa  296  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  93.75 
 
 		 144 aa  279  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  90.28 
 
 		 144 aa  270  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1783  putative transcriptional regulator MerR  91.61 
 
 		 144 aa  266  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  94.81 
 
 		 144 aa  265  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  90.78 
 
 		 144 aa  261  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0083  putative transcriptional regulator MerR  94.07 
 
 		 144 aa  261  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68539 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6498  putative transcriptional regulator MerR  94.03 
 
 		 144 aa  259  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0239269  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  88.11 
 
 		 144 aa  259  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6171  putative transcriptional regulator MerR  94.03 
 
 		 144 aa  259  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000597544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6344  Hg(II) resistance regulatory protein MerR  94.03 
 
 		 162 aa  259  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000851109  unclonable  0.0000000537327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2341  putative transcriptional regulator MerR  94.03 
 
 		 144 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0101  putative transcriptional regulator MerR  94.03 
 
 		 144 aa  259  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15480  putative transcriptional regulator MerR  94.03 
 
 		 144 aa  259  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000744936  unclonable  4.377399999999999e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  92.48 
 
 		 151 aa  255  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  77.94 
 
 		 136 aa  219  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1301  MerR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 135 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2312  MerR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 135 aa  202  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.000000000000678056  hitchhiker  0.000026005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1339  mercuric resistance operon regulatory protein  69.17 
 
 		 135 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  69.4 
 
 		 135 aa  197  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  68.42 
 
 		 135 aa  194  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 135 aa  190  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  63.91 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 135 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 135 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 146 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0164  transcriptional regulator, MerR family  59.52 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.768188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0159  transcriptional regulator, MerR family  59.52 
 
 		 135 aa  157  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1620  MerR family transcriptional regulator  72.92 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230477  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0237  MerR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  52.46 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  52.8 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  48.8 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  48.8 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  48.46 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  42.97 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.6 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 173 aa  103  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  44.62 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 167 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 135 aa  101  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1123  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.23 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  41.6 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 172 aa  93.6  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0060  hypothetical protein  38.35 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  36.57 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  40.8 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0059  hypothetical protein  37.59 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.6 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.52 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  38.52 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  38.52 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  36.57 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  48.04 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 137 aa  88.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  46.39 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2325  MerR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  38.94 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  36.57 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  39.84 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  37.72 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1623  MerR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.473197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  37.4 
 
 		 141 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>