More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0146 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  100 
 
 		 106 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 96 aa  140  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 95 aa  136  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  68.09 
 
 		 96 aa  134  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3627  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 95 aa  124  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03704  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 97 aa  123  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1692  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0464851  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  53.19 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  53.19 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  53.19 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1622  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  51.06 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  58.51 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  51.06 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  51.06 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  51.06 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  55.32 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  55.32 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 		 98 aa  115  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  60.22 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  56.12 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  59.78 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 		 98 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 97 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 97 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 97 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  57.89 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 97 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0859  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206391  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 97 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 97 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  110  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>