39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_pSN254_0144 on replicon NC_009140
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009140  SNSL254_pSN254_0144  aminoglycoside resistance protein  100 
 
 		 335 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0063  aminoglycoside resistance protein  97.34 
 
 		 263 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0135  aminoglycoside resistance protein  89.1 
 
 		 267 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0065  aminoglycoside resistance protein  88.97 
 
 		 263 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.577085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  58.24 
 
 		 269 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2105  aminoglycoside resistance protein  58.7 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3549  aminoglycoside resistance protein  60.17 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2178  aminoglycoside resistance protein  55.02 
 
 		 295 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120718  normal  0.0590756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1370  aminoglycoside resistance protein  44.96 
 
 		 289 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  hitchhiker  0.000262093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1354  aminoglycoside resistance protein  44.96 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000229675  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1385  aminoglycoside resistance protein  45.14 
 
 		 289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.206124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1916  aminoglycoside resistance protein  44.57 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000483855  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  41.04 
 
 		 272 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  40.4 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  35.63 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  35.63 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  35.63 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  35.63 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  35.63 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  35.63 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  35.63 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0133  streptothricin acetyltransferase Sat-1  100 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1735  adenylyltransferase  38.36 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000530526  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0092  hypothetical protein  37.5 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.479287  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5877  streptomycin 3''-adenylyltransferase  35.39 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3874  streptomycin 3''-adenylyltransferase  46.05 
 
 		 151 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0636766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0161  adenyltransferase  50 
 
 		 136 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.620989  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4803  adenylyltransferase  36.65 
 
 		 236 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.318391  normal  0.225807 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0068  streptothricin acetyltransferase Sat-1  100 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470432  normal  0.337184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3372  streptomycin 3''-adenylyltransferase  46.9 
 
 		 131 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20670  nucleotidyltransferase family protein  34.91 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117962  normal  0.282766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  26.92 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  26.52 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0454  hypothetical protein  26.18 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3186  hypothetical protein  20.54 
 
 		 195 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  25.4 
 
 		 601 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  25.11 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0824  nucleotidyltransferase  22.69 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.388218  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0068  hypothetical protein  24.43 
 
 		 260 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>