146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4847 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2964  bacteriophage P4 DNA primase  76.13 
 
 		 777 aa  1221    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273638 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  82.56 
 
 		 777 aa  1330    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3269  P4 family phage/plasmid primase  58.38 
 
 		 775 aa  913    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.592172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  58.94 
 
 		 775 aa  919    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3110  plasmid and phage DNA primase  75.36 
 
 		 777 aa  1206    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.926213  normal  0.17029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4847  bacteriophage P4 DNA primase  100 
 
 		 776 aa  1616    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.645663  normal  0.521901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0043  P4 family phage/plasmid primase  72.54 
 
 		 777 aa  1166    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1053  P4 family phage/plasmid primase  72.54 
 
 		 777 aa  1167    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  72.54 
 
 		 777 aa  1167    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  39.59 
 
 		 763 aa  542  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3860  D5 family nucleoside triphosphatase  39.34 
 
 		 763 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503803  normal  0.0447982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0946  D5 family nucleoside triphosphatase  50.21 
 
 		 605 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0622  P4 family phage/plasmid primase  49.89 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.77951  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0533  phage DNA primase-like protein  31.55 
 
 		 636 aa  206  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0606801  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3707  P4 alpha zinc-binding domain protein  37.65 
 
 		 681 aa  180  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3548  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.86 
 
 		 681 aa  178  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.88149  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  36.53 
 
 		 895 aa  178  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3699  P4 alpha zinc-binding domain protein  36.94 
 
 		 678 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.482092  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  35.85 
 
 		 890 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  35.85 
 
 		 890 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  32.62 
 
 		 878 aa  140  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0945  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 273 aa  134  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.550543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2243  hypothetical protein  31.33 
 
 		 368 aa  132  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  31.63 
 
 		 899 aa  132  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 929 aa  125  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0469  bacteriophage DNA primase  35.4 
 
 		 338 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.419516 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  29.08 
 
 		 1145 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  30.71 
 
 		 1172 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  30.71 
 
 		 1172 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  27.27 
 
 		 632 aa  97.4  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  90.1  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  28.15 
 
 		 336 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2820  hypothetical protein  36.2 
 
 		 275 aa  86.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  32.84 
 
 		 813 aa  85.9  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1077 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  24.84 
 
 		 1000 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1360  hypothetical protein  33.55 
 
 		 272 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  38.78 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2483  hypothetical protein  29.28 
 
 		 848 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  27 
 
 		 336 aa  77  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  29.68 
 
 		 782 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1865  hypothetical protein  27.78 
 
 		 746 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0964  hypothetical protein  34 
 
 		 278 aa  76.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0049  DNA primase, putative  26.89 
 
 		 1389 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2983  hypothetical protein  37.5 
 
 		 271 aa  73.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0057  DNA primase TraC  25.77 
 
 		 1557 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  41.49 
 
 		 847 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  22.48 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.61 
 
 		 355 aa  72  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  26.51 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  32.58 
 
 		 1448 aa  71.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3418  DNA primase domain protein  28.93 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0205684  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1448 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2130  TOPRIM domain-containing protein  35.42 
 
 		 277 aa  70.5  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.647312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0931  hypothetical protein  35.45 
 
 		 818 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3038  TraC domain-containing protein  27.57 
 
 		 736 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  43.42 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  43.42 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  29.94 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  42.86 
 
 		 355 aa  67  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  27.03 
 
 		 717 aa  67  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0951  DNA primase  29.33 
 
 		 354 aa  67  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.760511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  27.78 
 
 		 778 aa  66.6  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2711  hypothetical protein  34.31 
 
 		 297 aa  66.6  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0943  DNA primase  29.33 
 
 		 621 aa  66.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  22.35 
 
 		 771 aa  65.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  27.03 
 
 		 717 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2480  hypothetical protein  29.81 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2406  TOPRIM domain-containing protein  32.41 
 
 		 797 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.348772  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  25 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1765  putative DNA replication primase  27.57 
 
 		 621 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121744  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  46.05 
 
 		 866 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  24.04 
 
 		 738 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  27.24 
 
 		 341 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  29.09 
 
 		 950 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  30.49 
 
 		 833 aa  62.4  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0834  TOPRIM domain-containing protein  28 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  23.37 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  24.93 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  41.1 
 
 		 371 aa  60.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  26.25 
 
 		 717 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1495 aa  60.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  29.89 
 
 		 986 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  30.77 
 
 		 955 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1580 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1624  primase 2  30.81 
 
 		 309 aa  59.7  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  25.11 
 
 		 612 aa  58.9  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  30.77 
 
 		 950 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0017  cpp22  24.71 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  30.12 
 
 		 958 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  30.12 
 
 		 958 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3978  virulence-associated E family protein  25.87 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00795636  normal  0.108518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1166  virulence-associated E family protein  35.09 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.67711 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a034  DNA primase TraC  24.12 
 
 		 411 aa  57  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000906567  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  33.94 
 
 		 953 aa  56.6  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  23.79 
 
 		 1285 aa  55.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a039  DNA primase TraC  24.12 
 
 		 357 aa  55.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000018393  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  20.87 
 
 		 507 aa  55.8  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2646  putative DNA replication primase protein  35.64 
 
 		 620 aa  54.3  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>