More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4621 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05626  Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1)(Acetate--CoA ligase)(Acyl-activating enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16928]  50.63 
 
 
670 aa  650    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0101756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  95.4 
 
 
652 aa  1295    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  95.25 
 
 
652 aa  1293    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  68.1 
 
 
653 aa  947    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  60.47 
 
 
644 aa  833    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  60.8 
 
 
662 aa  826    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  64.61 
 
 
644 aa  888    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  60.41 
 
 
648 aa  805    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  62.75 
 
 
645 aa  845    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  66.35 
 
 
651 aa  883    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  68.84 
 
 
650 aa  955    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  67.95 
 
 
651 aa  939    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  52.58 
 
 
649 aa  732    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  55.57 
 
 
652 aa  689    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  54.92 
 
 
652 aa  686    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  53.94 
 
 
633 aa  651    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  67.44 
 
 
651 aa  936    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  59.24 
 
 
653 aa  783    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  68.37 
 
 
650 aa  954    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  52.1 
 
 
656 aa  636    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  54.06 
 
 
658 aa  679    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  52.2 
 
 
660 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  51.83 
 
 
655 aa  661    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  64.69 
 
 
652 aa  878    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  54.43 
 
 
657 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  91.26 
 
 
652 aa  1258    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.91 
 
 
657 aa  666    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  67.59 
 
 
651 aa  936    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  60.89 
 
 
645 aa  813    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  62.75 
 
 
653 aa  836    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.41 
 
 
656 aa  661    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  52.62 
 
 
667 aa  665    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.28 
 
 
673 aa  675    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  51.23 
 
 
666 aa  668    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  52.97 
 
 
657 aa  652    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  58.57 
 
 
661 aa  751    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  52.46 
 
 
653 aa  660    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  51.82 
 
 
636 aa  661    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  54.25 
 
 
660 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.22 
 
 
656 aa  690    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  66.36 
 
 
646 aa  887    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  68.74 
 
 
653 aa  944    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
666 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  66.14 
 
 
652 aa  900    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  66.77 
 
 
649 aa  907    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  61.11 
 
 
645 aa  796    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  61.67 
 
 
652 aa  853    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  62.13 
 
 
645 aa  845    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  66.03 
 
 
647 aa  890    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  52.72 
 
 
654 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  52.7 
 
 
660 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1380  acetyl-CoA synthetase  52.19 
 
 
653 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.110945  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  62.21 
 
 
653 aa  834    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  67.7 
 
 
651 aa  942    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  69.15 
 
 
650 aa  960    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  65.99 
 
 
650 aa  896    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  65.32 
 
 
649 aa  902    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  64.84 
 
 
652 aa  877    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  59.55 
 
 
655 aa  800    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  51.15 
 
 
660 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  55.09 
 
 
652 aa  685    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  54.03 
 
 
655 aa  674    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  61.93 
 
 
652 aa  798    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  63.57 
 
 
654 aa  814    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  53.68 
 
 
658 aa  685    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  62.75 
 
 
653 aa  837    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
660 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  53.82 
 
 
644 aa  684    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  63.88 
 
 
646 aa  867    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  67.59 
 
 
654 aa  912    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  53.22 
 
 
631 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  54.37 
 
 
655 aa  677    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  69.15 
 
 
650 aa  959    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  69.15 
 
 
650 aa  959    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  62.38 
 
 
645 aa  848    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  67.29 
 
 
650 aa  942    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  64.06 
 
 
651 aa  860    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  50 
 
 
660 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  72.99 
 
 
649 aa  1016    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  66.51 
 
 
651 aa  932    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  63.37 
 
 
645 aa  857    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1533  acetyl-CoA synthetase  66.82 
 
 
650 aa  932    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  52.46 
 
 
644 aa  672    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  64.74 
 
 
650 aa  880    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.01 
 
 
660 aa  662    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  62.17 
 
 
644 aa  836    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  68.99 
 
 
650 aa  960    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  53.37 
 
 
657 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  51 
 
 
667 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  62.99 
 
 
651 aa  830    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  62.99 
 
 
651 aa  830    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  66.35 
 
 
651 aa  884    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  54.06 
 
 
658 aa  678    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  68.37 
 
 
650 aa  950    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  50.08 
 
 
660 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  72.14 
 
 
649 aa  1006    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  61.67 
 
 
645 aa  839    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  70.74 
 
 
649 aa  980    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  57.38 
 
 
661 aa  746    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  51.29 
 
 
660 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>