More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4395 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  97.49 
 
 
319 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  96.87 
 
 
319 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  96.55 
 
 
319 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  100 
 
 
319 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  99.06 
 
 
319 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  42.35 
 
 
308 aa  271  8.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  42.81 
 
 
323 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  41.64 
 
 
337 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  44.23 
 
 
307 aa  255  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  44.12 
 
 
311 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  43.73 
 
 
306 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  43.73 
 
 
309 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  40.45 
 
 
311 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  41.1 
 
 
307 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  41.39 
 
 
298 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  40.53 
 
 
304 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  40.2 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 
322 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.55 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.68 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  35.87 
 
 
319 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  32.35 
 
 
313 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  32.35 
 
 
313 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  32.35 
 
 
313 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  33.01 
 
 
313 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  33.01 
 
 
313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  35.03 
 
 
319 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 
319 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.29 
 
 
322 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  31.78 
 
 
319 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  27.8 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
319 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
319 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  31.78 
 
 
319 aa  139  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  31.31 
 
 
336 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 
319 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  30.07 
 
 
321 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  34.97 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  31.7 
 
 
317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  33.33 
 
 
337 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.84 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  30.99 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  30.99 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.5 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  30.67 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  32.52 
 
 
338 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  32.22 
 
 
338 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  30.65 
 
 
322 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  33.57 
 
 
322 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  26.45 
 
 
310 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  32.29 
 
 
343 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  30 
 
 
315 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  30.16 
 
 
320 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.21 
 
 
347 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.52 
 
 
315 aa  122  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  28.16 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  30 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  27.36 
 
 
314 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.45 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  26.82 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  32.69 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.13 
 
 
302 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  29.57 
 
 
645 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  33.53 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  30.52 
 
 
320 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  28.57 
 
 
316 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  29.08 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  28.27 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29.19 
 
 
317 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  30.56 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.12 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 
316 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.13 
 
 
302 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  28.01 
 
 
338 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  28.98 
 
 
315 aa  109  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.85 
 
 
323 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  28.76 
 
 
327 aa  109  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  31.1 
 
 
316 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.85 
 
 
333 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.85 
 
 
333 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  30.07 
 
 
345 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  26.86 
 
 
312 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  30.46 
 
 
324 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  23.08 
 
 
628 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.27 
 
 
317 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  23.26 
 
 
628 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  28.27 
 
 
316 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.97 
 
 
315 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  30.8 
 
 
306 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  29.62 
 
 
305 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  32.55 
 
 
302 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  32.55 
 
 
302 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  32.55 
 
 
302 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2251  putative fructokinase  32.55 
 
 
302 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.763261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>