68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4347 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  100 
 
 
166 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  100 
 
 
166 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  100 
 
 
166 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  100 
 
 
166 aa  337  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  99.4 
 
 
166 aa  336  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  88.08 
 
 
166 aa  274  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  88.08 
 
 
166 aa  274  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  88.08 
 
 
166 aa  274  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  88.08 
 
 
166 aa  274  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  88.08 
 
 
166 aa  274  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  88.08 
 
 
167 aa  274  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  87.42 
 
 
166 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  87.42 
 
 
166 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  85.81 
 
 
170 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  77.58 
 
 
166 aa  254  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  66.21 
 
 
147 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  53.09 
 
 
162 aa  159  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  53.09 
 
 
162 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  53.09 
 
 
162 aa  159  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4032  putative stress resistance protein  53.64 
 
 
190 aa  150  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  49.32 
 
 
174 aa  140  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  48.65 
 
 
174 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  53.54 
 
 
174 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  33.99 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  34.46 
 
 
158 aa  84.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  32.67 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  33.11 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  31.17 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  31.58 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  30.32 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  30.32 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  29.68 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  29.68 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  29.68 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  30.26 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  30.26 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  30.26 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  29.68 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  29.68 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  29.33 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  32.65 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  30.82 
 
 
154 aa  61.6  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  28.67 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  29.63 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  31.68 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  32.21 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  33.77 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  35.29 
 
 
168 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  28.89 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  30.09 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  34.78 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  26.87 
 
 
163 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  37.89 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  27.89 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  27.21 
 
 
174 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  29.29 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  26.62 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  25.81 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  31.61 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  25.64 
 
 
163 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2222  hypothetical protein  38.82 
 
 
191 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  26.53 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  26.53 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  31.48 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  29.93 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  33.78 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  23.75 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  27.1 
 
 
170 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>