More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4327 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  79.84 
 
 
382 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  99.48 
 
 
382 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  98.95 
 
 
382 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  99.21 
 
 
382 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  80.1 
 
 
382 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  99.48 
 
 
382 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  79.84 
 
 
382 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  100 
 
 
382 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  92.15 
 
 
382 aa  728    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  46.86 
 
 
382 aa  359  5e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.12 
 
 
384 aa  358  8e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.98 
 
 
382 aa  357  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  46.6 
 
 
382 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  47.87 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 
382 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 
382 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
383 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
383 aa  346  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
383 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
383 aa  347  3e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
383 aa  347  3e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
383 aa  347  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 
382 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  46.81 
 
 
383 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 
382 aa  347  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  46.81 
 
 
383 aa  345  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  46.54 
 
 
383 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  47.38 
 
 
382 aa  344  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 
382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 
383 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
382 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 
402 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 
383 aa  341  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.81 
 
 
382 aa  340  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  48.95 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  47.12 
 
 
382 aa  339  4e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  47.14 
 
 
382 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.58 
 
 
383 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.48 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.34 
 
 
382 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.21 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  46.54 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.17 
 
 
383 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.74 
 
 
383 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 
382 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 
382 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 
382 aa  335  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  47.38 
 
 
382 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.6 
 
 
382 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
382 aa  334  1e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  45.74 
 
 
383 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 
383 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2001  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.84 
 
 
387 aa  332  5e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.38 
 
 
393 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.36 
 
 
393 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 
383 aa  330  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  44.76 
 
 
382 aa  329  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.5 
 
 
382 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1943  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.84 
 
 
399 aa  328  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.07 
 
 
387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.29 
 
 
382 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  46.86 
 
 
393 aa  325  6e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2848  alcohol dehydrogenase, class IV  45.09 
 
 
389 aa  324  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 
388 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.41 
 
 
387 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  45.29 
 
 
393 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.09 
 
 
387 aa  316  4e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 
393 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.23 
 
 
389 aa  315  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1353  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.41 
 
 
387 aa  315  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.959336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0251  alcohol dehydrogenase, class IV  47.38 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0255  alcohol dehydrogenase, class IV  46.46 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1594  alcohol dehydrogenase, class IV  47.12 
 
 
390 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2420  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.88 
 
 
387 aa  310  4e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.62 
 
 
387 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2097  EutG protein  47.61 
 
 
415 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0887  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.36 
 
 
387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000472566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2237  EutG protein  47.61 
 
 
490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.113437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2042  EutG protein  47.61 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.17622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1046  Iron-containing alcohol dehydrogenase  45.67 
 
 
387 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0545646  hitchhiker  0.000000369007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.55 
 
 
383 aa  306  6e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.8 
 
 
383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2335  alcohol dehydrogenase, iron-containing  47.34 
 
 
637 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.359123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  44.56 
 
 
382 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.13 
 
 
358 aa  299  5e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  44.3 
 
 
382 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.57 
 
 
383 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.83 
 
 
383 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.95 
 
 
382 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.95 
 
 
382 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  43.95 
 
 
382 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  42.63 
 
 
382 aa  289  7e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  42.63 
 
 
382 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  42.63 
 
 
383 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  42.63 
 
 
382 aa  288  9e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  42.63 
 
 
383 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>