290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4158 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  100 
 
 
147 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  99.32 
 
 
147 aa  291  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  98.64 
 
 
147 aa  290  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  97.96 
 
 
147 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  97.96 
 
 
147 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  89.8 
 
 
147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4258  flavodoxin  89.8 
 
 
147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  89.8 
 
 
147 aa  270  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  89.8 
 
 
147 aa  270  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  89.12 
 
 
147 aa  270  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  89.8 
 
 
147 aa  270  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  89.8 
 
 
147 aa  270  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4110  flavodoxin  88.44 
 
 
147 aa  268  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00157562  normal  0.0815779 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  87.76 
 
 
147 aa  267  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  78.91 
 
 
159 aa  244  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  68.49 
 
 
146 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  68.49 
 
 
146 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  68.49 
 
 
146 aa  218  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  69.18 
 
 
146 aa  215  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  68.71 
 
 
147 aa  213  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  65.99 
 
 
147 aa  210  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  66.67 
 
 
147 aa  207  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.27 
 
 
147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  47.89 
 
 
149 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  46.1 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  45.21 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  47.06 
 
 
146 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  45.89 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  46.58 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  47.06 
 
 
144 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0001  flavodoxin  43.36 
 
 
144 aa  137  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  43.15 
 
 
150 aa  135  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  42.25 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  42.96 
 
 
146 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  42.96 
 
 
146 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  42.96 
 
 
146 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  41.55 
 
 
146 aa  133  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  43.15 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  42.25 
 
 
146 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  44.52 
 
 
147 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  41.55 
 
 
146 aa  130  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3968  flavodoxin  38.36 
 
 
153 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  40.85 
 
 
146 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  39.73 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.31 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4309  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.14 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.44 
 
 
145 aa  120  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.41 
 
 
148 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  39.74 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  36.11 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  36.11 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5048  mioC protein  34.97 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00482847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.99 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  33.11 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  32.19 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  32.89 
 
 
154 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  32.64 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  31.58 
 
 
154 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  31.54 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  31.54 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  30.92 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  31.54 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  30.92 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  30.92 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  34.69 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  34.01 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  33.11 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  33.56 
 
 
149 aa  84  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  30.87 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  31.54 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  31.54 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.551035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  33.56 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  31.54 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  31.54 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  31.58 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0897  flavodoxin  38.51 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  32.21 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  32.21 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3285  flavodoxin  31.54 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339839  normal  0.738816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  32.21 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  29.53 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  32.88 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.29 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.08 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  31.08 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0936  flavodoxin  31.54 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000373319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  31.08 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02635  flavodoxin  31.08 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2934  flavodoxin  31.08 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02597  hypothetical protein  31.08 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.917177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  31.08 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0922  flavodoxin  31.08 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2930  flavodoxin  30.41 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4628  flavodoxin  35.14 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4488  flavodoxin  35.14 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  29.73 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3365  flavodoxin  30.52 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4612  flavodoxin  33.78 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263285  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  29.92 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  34.03 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>