More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4055 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4106  beta-glucosidase  99.57 
 
 		 460 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4001  beta-glucosidase  99.35 
 
 		 460 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2667  Beta-glucosidase  66.96 
 
 		 470 aa  660    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4171  beta-glucosidase  99.78 
 
 		 460 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663192  normal  0.656643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0030  Beta-glucosidase  78.77 
 
 		 470 aa  776    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3983  beta-glucosidase  99.13 
 
 		 460 aa  960    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4055  beta-glucosidase  100 
 
 		 460 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  0.0647863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0836  Beta-glucosidase  65.29 
 
 		 461 aa  645    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0035  Beta-glucosidase  78.77 
 
 		 465 aa  778    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0036  Beta-glucosidase  81.96 
 
 		 462 aa  815    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0267  Beta-glucosidase  62.09 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  55.9 
 
 		 461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3120  Beta-glucosidase  55.53 
 
 		 460 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.29426  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0202  Beta-glucosidase  53.83 
 
 		 459 aa  548  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3201  Beta-glucosidase  53.83 
 
 		 470 aa  544  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.281249  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0682  glycoside hydrolase family 1  53.36 
 
 		 461 aa  537  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0153  Beta-glucosidase  53.51 
 
 		 457 aa  522  1e-147  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2609  glycosy hydrolase family protein  53.03 
 
 		 459 aa  508  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2295  beta-glucosidase a  51.95 
 
 		 459 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4095  glycoside hydrolase family 1  48.7 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.362343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1473  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  46.42 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.27545  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1586  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  46.27 
 
 		 479 aa  413  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.816968  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl425  beta-glucosidase  41.36 
 
 		 452 aa  359  5e-98  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00336379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0737  glycoside hydrolase family 1  42.95 
 
 		 478 aa  359  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0757  glycoside hydrolase family 1  42.6 
 
 		 478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3468  glycoside hydrolase family 1  41.28 
 
 		 478 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3281  glycoside hydrolase family protein  40.8 
 
 		 475 aa  342  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0078  glycoside hydrolase family 1  39.57 
 
 		 465 aa  341  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  36.77 
 
 		 467 aa  315  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  36.24 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  36.03 
 
 		 446 aa  309  8e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  36.78 
 
 		 451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  37.19 
 
 		 444 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  35.45 
 
 		 453 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  33.7 
 
 		 474 aa  299  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  34.27 
 
 		 471 aa  299  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  37.25 
 
 		 457 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  35.41 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  35.92 
 
 		 458 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  36.11 
 
 		 459 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3531  Beta-glucosidase  35.96 
 
 		 469 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.594772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  33.7 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  35.6 
 
 		 439 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  36.17 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  36.7 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  35.45 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  36.59 
 
 		 457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  35.37 
 
 		 446 aa  288  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  34.7 
 
 		 478 aa  286  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  34.18 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  35.21 
 
 		 476 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  35.03 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  35.92 
 
 		 438 aa  282  7.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  35.75 
 
 		 482 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  34.88 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0184  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  33.96 
 
 		 478 aa  279  6e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  32.84 
 
 		 487 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  35.78 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  35.56 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  35.42 
 
 		 474 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  35.98 
 
 		 468 aa  277  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  34.66 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  33.99 
 
 		 488 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0705  6-phospho-beta-glucosidase  34.42 
 
 		 469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.76639  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  36 
 
 		 443 aa  274  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  35.12 
 
 		 474 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  36.36 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  34.08 
 
 		 467 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  35.16 
 
 		 494 aa  272  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  36.14 
 
 		 448 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  35.03 
 
 		 478 aa  272  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  32.97 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0657  beta-galactosidase  33.63 
 
 		 445 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  35.76 
 
 		 448 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  34.8 
 
 		 458 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  31.84 
 
 		 452 aa  269  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  34.14 
 
 		 439 aa  267  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  34.06 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  34.54 
 
 		 909 aa  267  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  33.26 
 
 		 470 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  33.82 
 
 		 517 aa  266  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  34.06 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  34.36 
 
 		 455 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  35.36 
 
 		 482 aa  266  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  33.62 
 
 		 484 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  33.48 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  35.41 
 
 		 453 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  35.59 
 
 		 436 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  33.54 
 
 		 499 aa  264  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  34.32 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl313  beta-glucosidase/alpha xylosidase  33.33 
 
 		 469 aa  262  8e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000597092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  33.55 
 
 		 472 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  31.78 
 
 		 475 aa  261  3e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  35.19 
 
 		 447 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  35.13 
 
 		 479 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  32.98 
 
 		 479 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  34.07 
 
 		 465 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  32.9 
 
 		 462 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  34.26 
 
 		 466 aa  259  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  32.74 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>