198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4044 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  99.68 
 
 
315 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 
315 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  99.68 
 
 
315 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  99.68 
 
 
315 aa  617  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  99.37 
 
 
315 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  89.6 
 
 
307 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.6 
 
 
307 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  89.6 
 
 
307 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.93 
 
 
307 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.26 
 
 
307 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.6 
 
 
307 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.6 
 
 
307 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  88.59 
 
 
299 aa  502  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  88.93 
 
 
307 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  80.67 
 
 
301 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  38.7 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  38.46 
 
 
297 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.95 
 
 
314 aa  185  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.37 
 
 
303 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  36.21 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  36.09 
 
 
308 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  36.05 
 
 
308 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  34.68 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  35.02 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  34.68 
 
 
308 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  34.68 
 
 
308 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  34.74 
 
 
299 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  35.79 
 
 
308 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  35.23 
 
 
310 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  33.67 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  36.56 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  36.18 
 
 
306 aa  162  8.000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  35.23 
 
 
308 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  34.22 
 
 
296 aa  160  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  33.44 
 
 
309 aa  156  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  32.91 
 
 
319 aa  155  8e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  31.7 
 
 
322 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  34.71 
 
 
296 aa  151  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  33.77 
 
 
322 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  33.99 
 
 
304 aa  149  7e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  32.03 
 
 
322 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.22 
 
 
309 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  29.81 
 
 
325 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  30.87 
 
 
321 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  32.75 
 
 
290 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  32.39 
 
 
290 aa  143  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  33.22 
 
 
299 aa  143  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
331 aa  139  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 
530 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  34.13 
 
 
295 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 
293 aa  136  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  29.04 
 
 
305 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  27.39 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  28.62 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  30.39 
 
 
321 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  30.72 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  30.72 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  30.72 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  30.72 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  31.37 
 
 
320 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  31.37 
 
 
320 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  29.74 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26 
 
 
520 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  29.17 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  29.59 
 
 
315 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 
310 aa  94  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.03 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  29.97 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  34.33 
 
 
150 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.19 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  24.39 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  26.14 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.58 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.24 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  24.6 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 
348 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  26.01 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.43 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  26.09 
 
 
324 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.17 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.08 
 
 
317 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.84 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  25.27 
 
 
303 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.91 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  30.19 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.56 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.56 
 
 
303 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.56 
 
 
303 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.54 
 
 
301 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.56 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.44 
 
 
341 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  24.56 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  24.01 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>