More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3845 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  85.09 
 
 		 732 aa  1205    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  85.23 
 
 		 732 aa  1208    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  63.17 
 
 		 771 aa  863    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  85.64 
 
 		 732 aa  1212    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  60.13 
 
 		 784 aa  830    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  56.81 
 
 		 689 aa  734    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  64.96 
 
 		 782 aa  829    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  99.45 
 
 		 732 aa  1450    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  56.86 
 
 		 768 aa  765    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  60.4 
 
 		 787 aa  831    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  85.11 
 
 		 732 aa  1213    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  100 
 
 		 732 aa  1457    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  99.04 
 
 		 732 aa  1445    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  85.64 
 
 		 732 aa  1213    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  55.53 
 
 		 768 aa  733    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  61.48 
 
 		 803 aa  829    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  85.09 
 
 		 732 aa  1205    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  85.36 
 
 		 732 aa  1208    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  77.72 
 
 		 728 aa  1092    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  85.23 
 
 		 732 aa  1206    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  85.36 
 
 		 732 aa  1208    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  64.42 
 
 		 788 aa  821    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  64.68 
 
 		 782 aa  826    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  54.73 
 
 		 773 aa  719    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  99.73 
 
 		 732 aa  1453    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  99.45 
 
 		 732 aa  1449    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  48.6 
 
 		 718 aa  611  1e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  46.35 
 
 		 904 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  47.8 
 
 		 740 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  47.53 
 
 		 740 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  48.09 
 
 		 712 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  49.93 
 
 		 722 aa  586  1e-166  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  44.38 
 
 		 738 aa  580  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  47.28 
 
 		 793 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  48.64 
 
 		 709 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  47.33 
 
 		 758 aa  577  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  47.92 
 
 		 732 aa  578  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  46.01 
 
 		 726 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  46.9 
 
 		 734 aa  570  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  48.58 
 
 		 711 aa  572  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  47.29 
 
 		 720 aa  572  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  46.21 
 
 		 844 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  46.26 
 
 		 734 aa  552  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  47.96 
 
 		 744 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  46.5 
 
 		 713 aa  550  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  46.86 
 
 		 814 aa  547  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  46.98 
 
 		 803 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  48.33 
 
 		 712 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  46.19 
 
 		 731 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  46.31 
 
 		 704 aa  542  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  46.05 
 
 		 716 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  43.24 
 
 		 955 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  51.54 
 
 		 757 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  50.51 
 
 		 678 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  46.69 
 
 		 731 aa  524  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  44.79 
 
 		 764 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  52.05 
 
 		 758 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  46.34 
 
 		 759 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  51.02 
 
 		 634 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  46.4 
 
 		 759 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  51.62 
 
 		 756 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  39.2 
 
 		 712 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.68 
 
 		 712 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 712 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  36.88 
 
 		 783 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  51 
 
 		 777 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 707 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.27 
 
 		 709 aa  458  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 		 800 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  44.39 
 
 		 673 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  38.28 
 
 		 800 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 734 aa  452  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  40.46 
 
 		 735 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 		 833 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  38.94 
 
 		 713 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 701 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  37.86 
 
 		 799 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  38.63 
 
 		 750 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  38.43 
 
 		 750 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  38.63 
 
 		 750 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 800 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  38.36 
 
 		 752 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  41.84 
 
 		 709 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  38.87 
 
 		 712 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  43.62 
 
 		 750 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  39.62 
 
 		 738 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 767 aa  426  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  37.58 
 
 		 742 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.47 
 
 		 726 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  38.56 
 
 		 748 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  38.12 
 
 		 769 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 984 aa  422  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  38.1 
 
 		 794 aa  422  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 984 aa  422  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 791 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  37.62 
 
 		 939 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  37.66 
 
 		 799 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 750 aa  415  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 		 801 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 737 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>