286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3784 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  97.8 
 
 		 227 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  97.36 
 
 		 227 aa  423  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  96.48 
 
 		 227 aa  420  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  96.92 
 
 		 227 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  84.14 
 
 		 227 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  84.14 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  84.14 
 
 		 227 aa  371  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  84.14 
 
 		 227 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  83.7 
 
 		 227 aa  367  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  83.7 
 
 		 227 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  83.26 
 
 		 227 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  83.26 
 
 		 227 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  83.26 
 
 		 227 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  67.84 
 
 		 227 aa  293  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  54.63 
 
 		 227 aa  248  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  52.36 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  51.07 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  57.14 
 
 		 239 aa  228  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  51.93 
 
 		 233 aa  207  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  48.07 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  48.07 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  48.07 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  44.8 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  36.28 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  37.67 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  38.65 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.53 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 		 246 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  38.7 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  39.13 
 
 		 244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  40.95 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  40.91 
 
 		 180 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  38.76 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  35.43 
 
 		 249 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  33.92 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  38.46 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  33.92 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  37.17 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  33.18 
 
 		 266 aa  118  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  33.04 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  34.8 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  37.67 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  33.19 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  35.56 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  36.32 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 271 aa  109  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  33.04 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  33.48 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  32.52 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  33.48 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  33.04 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.39 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  34.51 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  36.65 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.89 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  32.14 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  34.76 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  38.92 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.6 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  31.25 
 
 		 235 aa  104  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  31.86 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  33.04 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.11 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  37.44 
 
 		 247 aa  101  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  31.25 
 
 		 268 aa  101  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  30.8 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  31.4 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.33 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 		 257 aa  99.8  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  34.33 
 
 		 262 aa  98.6  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  30.36 
 
 		 262 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  34.72 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  29.91 
 
 		 252 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  31.98 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.9 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 		 258 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 258 aa  95.9  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34.22 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.99 
 
 		 250 aa  95.5  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  33.33 
 
 		 262 aa  95.5  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  31.88 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 		 269 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  35.39 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2767  phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 		 270 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  35.23 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>