215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2685 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  100 
 
 
379 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  99.74 
 
 
379 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  100 
 
 
379 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  99.74 
 
 
379 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  72.07 
 
 
382 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  67.37 
 
 
378 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  67.37 
 
 
378 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  67.37 
 
 
378 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  61.54 
 
 
384 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  62.15 
 
 
380 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  61.73 
 
 
388 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  59.79 
 
 
380 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  59.79 
 
 
380 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  60.48 
 
 
387 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  59.52 
 
 
380 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  57.94 
 
 
379 aa  411  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  59.79 
 
 
380 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  58.27 
 
 
381 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3228  glycerate kinase  61.46 
 
 
384 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0890898  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  60.21 
 
 
381 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2714  glycerate kinase  59.32 
 
 
384 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.426289  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  59.52 
 
 
380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  58.01 
 
 
381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  57.26 
 
 
380 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3134  glycerate kinase  56.61 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00500551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1470  glycerate kinase  56.81 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  59.42 
 
 
380 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  60.38 
 
 
408 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  60.38 
 
 
381 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  57.41 
 
 
382 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  60.38 
 
 
381 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  57.41 
 
 
382 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  57.41 
 
 
382 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  59.68 
 
 
380 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  60.38 
 
 
408 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  57.41 
 
 
382 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  60.38 
 
 
381 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  58.53 
 
 
381 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  60.38 
 
 
381 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  60.38 
 
 
381 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  60.11 
 
 
381 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  58.07 
 
 
384 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2779  glycerate kinase  54.87 
 
 
394 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  58.27 
 
 
381 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2642  glycerate kinase  55.84 
 
 
389 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.809212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  59.84 
 
 
381 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  59.47 
 
 
381 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  57.29 
 
 
377 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  61.48 
 
 
381 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  58.49 
 
 
379 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  56.8 
 
 
378 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2773  Glycerate kinase  54.73 
 
 
402 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.567771  hitchhiker  0.000390297 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1575  glycerate kinase  54.34 
 
 
403 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1604  glycerate kinase  53.48 
 
 
402 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.395644  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  52.65 
 
 
381 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  55.82 
 
 
381 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  55.44 
 
 
377 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  55.44 
 
 
381 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  55.7 
 
 
381 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1380  Glycerate kinase  59.68 
 
 
379 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.824242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  55.17 
 
 
381 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  54.91 
 
 
381 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  55.17 
 
 
381 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  55.17 
 
 
381 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1570  glycerate kinase  54.36 
 
 
403 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.769204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  55.17 
 
 
381 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  55.17 
 
 
381 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  51.88 
 
 
386 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  51.32 
 
 
381 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  54.67 
 
 
388 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  53.99 
 
 
379 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  54.67 
 
 
388 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  51.32 
 
 
381 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  55.03 
 
 
380 aa  364  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  54.67 
 
 
388 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  51.06 
 
 
385 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  54.88 
 
 
379 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  51.06 
 
 
381 aa  362  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3280  glycerate kinase  54.26 
 
 
379 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345259  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  53.7 
 
 
394 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  55.44 
 
 
378 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  50.79 
 
 
385 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  50.79 
 
 
381 aa  358  7e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  56.15 
 
 
383 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  51.59 
 
 
381 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  48.28 
 
 
384 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  52 
 
 
395 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  57.29 
 
 
389 aa  352  7e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  54.11 
 
 
379 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  51.87 
 
 
373 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  51.87 
 
 
373 aa  348  6e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  53.32 
 
 
381 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  48.15 
 
 
380 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  54.64 
 
 
380 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  47.75 
 
 
381 aa  340  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  48.53 
 
 
383 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  53.12 
 
 
381 aa  334  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  48.56 
 
 
383 aa  332  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  50.13 
 
 
380 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  50.13 
 
 
380 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>