126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2534 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2534  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000222092  normal  0.679181 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2588  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000391188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2576  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00212486  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2488  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000836998  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2697  phosphodiesterase  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000161935  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 183 aa  323  8.000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  85.16 
 
 		 184 aa  323  9e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  85.16 
 
 		 184 aa  323  9e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  80.87 
 
 		 183 aa  311  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  70.88 
 
 		 183 aa  270  8.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  71.43 
 
 		 183 aa  267  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  68.13 
 
 		 183 aa  264  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  68.68 
 
 		 183 aa  261  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  69.23 
 
 		 183 aa  260  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1434  phosphodiesterase  69.95 
 
 		 183 aa  258  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000439444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0347  phosphodiesterase  69.95 
 
 		 183 aa  258  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1544  phosphodiesterase  69.95 
 
 		 183 aa  258  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000690734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  56.91 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0963  phosphodiesterase  56.25 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0378446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004142  phosphodiesterase YfcE  54.4 
 
 		 181 aa  208  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2729  phosphodiesterase  53.55 
 
 		 187 aa  205  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01322  phosphodiesterase  53.3 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0502  phosphodiesterase  57.39 
 
 		 189 aa  197  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3090  phosphodiesterase  50 
 
 		 186 aa  181  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0807  phosphodiesterase  51.98 
 
 		 193 aa  179  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2300  phosphodiesterase  45.11 
 
 		 188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2650  phosphodiesterase  49.44 
 
 		 182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06370  phosphoesterase, MJ0936 family  49.1 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.531926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3732  phosphodiesterase  42.29 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000397737  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1720  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.94 
 
 		 182 aa  154  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13980  phosphoesterase, MJ0936 family  44.13 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0076  phosphodiesterase, MJ0936 family  40.64 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1746  phosphodiesterase  41.08 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  36.41 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  38.69 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  38.1 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  40.12 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  36.77 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  35.83 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  34.57 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.35 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  34.66 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1539  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.09 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  29.76 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  27.42 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.39 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.61 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.49 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  27.98 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.79 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0618  phosphoesterase protein  31.82 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.06 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  32.33 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.45 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.96 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.96 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.38 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  26.13 
 
 		 239 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.41 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.65 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  26.64 
 
 		 259 aa  50.8  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  24.62 
 
 		 681 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  30.61 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  30.1 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.76 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  25 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.18 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.63 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.63 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.69 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  24.68 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  26.55 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0413  metallophosphoesterase  25.77 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0168  metallophosphoesterase  25.39 
 
 		 249 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  29.01 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  26.74 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  25.82 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  29.07 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  27.33 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  27.98 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  24.02 
 
 		 254 aa  45.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  23.73 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  27.81 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  27.81 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.46 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  27.81 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.7 
 
 		 167 aa  45.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.24 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.2 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  28.4 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  44.7  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  23.53 
 
 		 254 aa  44.7  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>