279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2441 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2600  quinol dehydrogenase membrane component  99.65 
 
 
289 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.419201 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2441  quinol dehydrogenase membrane component  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.437001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2497  quinol dehydrogenase membrane component  100 
 
 
289 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3341  quinol dehydrogenase membrane component  88.93 
 
 
287 aa  501  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.820241  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02131  quinol dehydrogenase membrane component  88.93 
 
 
287 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.217114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1455  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  88.93 
 
 
287 aa  500  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02090  hypothetical protein  88.93 
 
 
287 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2503  quinol dehydrogenase membrane component  88.93 
 
 
287 aa  500  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2342  quinol dehydrogenase membrane component  88.93 
 
 
287 aa  500  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2352  quinol dehydrogenase membrane component  88.93 
 
 
287 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1446  quinol dehydrogenase membrane component  88.57 
 
 
287 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0737  quinol dehydrogenase membrane component  88.57 
 
 
287 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2717  quinol dehydrogenase membrane component  72.86 
 
 
287 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2413  quinol dehydrogenase membrane component  74.64 
 
 
287 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1506  quinol dehydrogenase membrane component  55.52 
 
 
290 aa  359  3e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001238  polyferredoxin NapH (periplasmic nitrate reductase)  52.46 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4007  quinol dehydrogenase membrane component  53.28 
 
 
311 aa  299  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0621  quinol dehydrogenase membrane component  50.18 
 
 
298 aa  291  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3838  quinol dehydrogenase membrane component  47.87 
 
 
301 aa  289  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.497942  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3959  quinol dehydrogenase membrane component  45.64 
 
 
302 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2985  quinol dehydrogenase membrane component  49.47 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3320  quinol dehydrogenase membrane component  48.94 
 
 
327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159981  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3150  quinol dehydrogenase membrane component  49.09 
 
 
323 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413513  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3432  quinol dehydrogenase membrane component  48.94 
 
 
327 aa  280  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0970703  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3208  quinol dehydrogenase membrane component  49.11 
 
 
299 aa  279  5e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0702  quinol dehydrogenase membrane component  48.58 
 
 
332 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3163  quinol dehydrogenase membrane component  48.06 
 
 
302 aa  276  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0846  quinol dehydrogenase membrane component  48.01 
 
 
319 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0556  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  45.3 
 
 
287 aa  266  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1589  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  46.4 
 
 
285 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1341  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  47.67 
 
 
281 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3220  quinol dehydrogenase membrane component  48.95 
 
 
302 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0440  quinol dehydrogenase membrane component  41.82 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000255918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0555  periplasmic nitrate reductase subunit NapH  47.49 
 
 
283 aa  221  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4738  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  42.59 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199937  normal  0.474351 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1516  quinol dehydrogenase membrane component  40.07 
 
 
275 aa  206  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000106423  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0726  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  40.29 
 
 
279 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000359603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1930  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  35.47 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.019588  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1718  quinol dehydrogenase membrane component  33.84 
 
 
261 aa  168  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1159  quinol dehydrogenase membrane component  32.95 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.239139  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0803  quinol dehydrogenase membrane component  34.48 
 
 
259 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.113023  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0873  quinol dehydrogenase membrane component  34.48 
 
 
259 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  33.96 
 
 
263 aa  151  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0866  putative permease  37.74 
 
 
263 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1058  ferredoxin-type protein, NapH/MauN family  32.09 
 
 
272 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1723  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.91 
 
 
299 aa  125  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0668  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  29.49 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.236876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1742  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.57 
 
 
298 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  normal  0.0170059 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0446  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  30.71 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  30.87 
 
 
292 aa  118  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1304  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  27.87 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000969125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  30.07 
 
 
327 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1290  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.38 
 
 
470 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3044  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.83 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  25.68 
 
 
357 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1233  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  28.89 
 
 
407 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.668927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.09 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.42 
 
 
357 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  25.42 
 
 
357 aa  75.5  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  25.42 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  25.42 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.42 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.42 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.08 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.28 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.6 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1789  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.28 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.89 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.89 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.15 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0887  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.25 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.523499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0712  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.19 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000841077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  23.29 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  25.89 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0561  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.41 
 
 
591 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.19 
 
 
232 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000222654  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0956  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.89 
 
 
229 aa  67  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.13 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0717  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.41 
 
 
472 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.165472  normal  0.339839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1066  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  25.82 
 
 
451 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0665547  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1640  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.35 
 
 
524 aa  65.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.85 
 
 
326 aa  64.7  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.02 
 
 
216 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1582  polyferredoxin-like protein  25.57 
 
 
367 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.972652  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0463  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.24 
 
 
294 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1904  iron-sulfur cluster-binding protein  24.62 
 
 
346 aa  62.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000493805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0616  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  25.46 
 
 
331 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000698811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.34 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1810  polyferredoxin-like protein  23.56 
 
 
367 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  22.77 
 
 
480 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1984  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.61 
 
 
366 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.794956  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3506  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.41 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1359  polyferredoxin-like  25.89 
 
 
381 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.265188  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27420  4Fe-4S protein  22.33 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3335  Iron-sulfur cluster-binding protein  27.96 
 
 
354 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.67 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.6 
 
 
233 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310265  normal  0.576374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0666  polyferredoxin-like protein  25.28 
 
 
276 aa  60.1  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  24.31 
 
 
704 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>