66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2295 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1600  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaC  80.74 
 
 		 405 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2346  putative glycosyl transferase  98.27 
 
 		 405 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.31761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2339  putative glycosyl transferase  98.52 
 
 		 405 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.225754  normal  0.701653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2295  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 405 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0600773  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2238  putative glycosyl transferase  98.02 
 
 		 405 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1175  putative glycosyl transferase  80.49 
 
 		 405 aa  698    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2453  putative glycosyl transferase  98.52 
 
 		 405 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.449849  normal  0.0475636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1005  putative glycosyl transferase  80.49 
 
 		 405 aa  696    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1584  putative glycosyl transferase  80.25 
 
 		 405 aa  695    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2992  putative glycosyl transferase  80.74 
 
 		 405 aa  698    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2350  putative glycosyl transferase  80.25 
 
 		 405 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2671  putative glycosyl transferase  82.22 
 
 		 405 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01952  hypothetical protein  80.49 
 
 		 405 aa  697    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01963  predicted glycosyl transferase  80.49 
 
 		 405 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  24.22 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  24.93 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  24.05 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.22 
 
 		 2401 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.81 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  21.68 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 746 aa  52.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 		 362 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  27.95 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.62 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 389 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  31.25 
 
 		 383 aa  46.6  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  25.79 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1620  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 380 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  23.04 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  26.76 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  24.83 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  23.11 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3880  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1174  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 364 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 		 350 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1832  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 337 aa  43.1  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4369  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00420943  normal  0.404826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  41.3 
 
 		 387 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 		 376 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>