170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2159 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2212  outer membrane protein N  99.5 
 
 
398 aa  788  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466216  normal  0.580794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2159  outer membrane protein N  100 
 
 
398 aa  791  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.142593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  96.5 
 
 
400 aa  721  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  83.82 
 
 
403 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  72.64 
 
 
387 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  68.42 
 
 
383 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1572  outer membrane protein N  69.92 
 
 
380 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0737338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  68.17 
 
 
383 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  68.41 
 
 
388 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  68.42 
 
 
383 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  68.42 
 
 
378 aa  506  1e-142  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2553  porin  65.16 
 
 
373 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.437604 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01360  hypothetical protein  67.28 
 
 
377 aa  492  1e-138  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1560  outer membrane protein N  67.28 
 
 
377 aa  492  1e-138  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01348  outer membrane pore protein N, non-specific  67.28 
 
 
377 aa  492  1e-138  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1463  outer membrane protein N  67.28 
 
 
377 aa  492  1e-138  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510785  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2279  porin  67.28 
 
 
377 aa  492  1e-138  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1614  outer membrane protein N  67.28 
 
 
377 aa  491  1e-138  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.51983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2269  porin Gram-negative type  67.02 
 
 
377 aa  492  1e-138  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.421789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1776  outer membrane protein N  68.25 
 
 
372 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728933  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1730  porin  65.66 
 
 
369 aa  473  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00293132  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  63.34 
 
 
372 aa  465  1e-130  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  62.66 
 
 
362 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1687  outer membrane porin protein LC  62.66 
 
 
362 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.535168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  62.66 
 
 
362 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  62.66 
 
 
362 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  62.56 
 
 
370 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  63.07 
 
 
376 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  63.03 
 
 
378 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  62.78 
 
 
378 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  62.31 
 
 
368 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  62.66 
 
 
376 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  62.78 
 
 
378 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  62.78 
 
 
378 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  62.78 
 
 
378 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487875 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  63.57 
 
 
367 aa  447  1e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  62.81 
 
 
363 aa  446  1e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.92905e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  62.06 
 
 
367 aa  443  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  59.9 
 
 
360 aa  438  1e-122  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2057  porin  58.85 
 
 
359 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2778  outer membrane protein N  57.78 
 
 
371 aa  431  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.704962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1322  outer membrane protein C2  58.02 
 
 
371 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2857  porin  58.02 
 
 
371 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  62.41 
 
 
364 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  59.9 
 
 
371 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  57.96 
 
 
360 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  59.9 
 
 
371 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  60 
 
 
360 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  2.61923e-05  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  60 
 
 
360 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.0387e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  59.9 
 
 
371 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.9147e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  57.75 
 
 
366 aa  417  1e-115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  55.8 
 
 
365 aa  416  1e-115  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  60.5 
 
 
360 aa  417  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.7634e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  57.5 
 
 
366 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  54.61 
 
 
350 aa  408  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3366  porin Gram-negative type  54.36 
 
 
351 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1589  outer membrane porin protein LC  61.58 
 
 
333 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.810656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0273  outer membrane phosphoporin protein E  54.11 
 
 
351 aa  401  1e-110  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.664027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  54.11 
 
 
351 aa  401  1e-110  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  54.11 
 
 
351 aa  401  1e-110  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3340  outer membrane phosphoporin protein E  54.11 
 
 
351 aa  400  1e-110  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0268  outer membrane phosphoporin protein E  53.87 
 
 
351 aa  400  1e-110  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0360  outer membrane phosphoporin protein E  53.37 
 
 
350 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0351  outer membrane phosphoporin protein E  53.37 
 
 
350 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0369  outer membrane phosphoporin protein E  53.37 
 
 
350 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0354  outer membrane phosphoporin protein E  53.37 
 
 
350 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.52263  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0361  outer membrane phosphoporin protein E  53.12 
 
 
350 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  7.41681e-10 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00238  outer membrane phosphoporin protein E  53.94 
 
 
345 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.86907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0238  outer membrane phosphoporin protein E  53.12 
 
 
351 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00241  hypothetical protein  53.94 
 
 
345 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.693331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1642  outer membrane protein N  56.58 
 
 
372 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1701  outer membrane protein N  56.58 
 
 
372 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1806  outer membrane protein N  56.58 
 
 
372 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0174534  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1641  outer membrane protein N  56.58 
 
 
372 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00375551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1634  outer membrane protein N  56.58 
 
 
372 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.952827  normal  0.939851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  54.61 
 
 
357 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2191  outer membrane protein F  55.8 
 
 
357 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.466733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  54.61 
 
 
357 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02101  hypothetical protein  60.83 
 
 
329 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2667  outer membrane protein F  54.81 
 
 
362 aa  378  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000513703  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1037  outer membrane protein F  54.81 
 
 
362 aa  378  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.88881e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1029  outer membrane protein F  54.32 
 
 
362 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00117634  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2389  outer membrane protein F  54.32 
 
 
362 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00716646  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2714  porin Gram-negative type  54.32 
 
 
362 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.19637e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00933  outer membrane porin 1a (Ia;b;F)  54.32 
 
 
362 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  1.51629e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00940  hypothetical protein  54.32 
 
 
362 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  1.70376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  54.32 
 
 
362 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.11589e-05  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1784  porin Gram-negative type  52.81 
 
 
373 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00154811  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  52.37 
 
 
360 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  52.37 
 
 
360 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  52.37 
 
 
360 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  53.6 
 
 
363 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  53.6 
 
 
363 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  53.6 
 
 
363 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1448  porin  50.86 
 
 
368 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  53.6 
 
 
363 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  53.35 
 
 
363 aa  362  5e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.918744 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02142  outer membrane porin protein C  60.41 
 
 
311 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1636  porin Gram-negative type  48.91 
 
 
366 aa  315  1e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00881116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2056  porin Gram-negative type  47.62 
 
 
368 aa  312  5e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0706527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>