More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2153 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  99.67 
 
 
306 aa  590  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  99.67 
 
 
306 aa  590  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  99.67 
 
 
306 aa  590  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  98.37 
 
 
306 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  87.91 
 
 
306 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  87.91 
 
 
306 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  87.58 
 
 
306 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  87.58 
 
 
306 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  87.58 
 
 
306 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  87.58 
 
 
306 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  87.58 
 
 
306 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  83.17 
 
 
304 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  68.97 
 
 
296 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  68.62 
 
 
296 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  68.97 
 
 
296 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  68.46 
 
 
307 aa  362  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  59.64 
 
 
296 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  55.86 
 
 
316 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  58.09 
 
 
296 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  56.23 
 
 
306 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  55.56 
 
 
304 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  55.89 
 
 
306 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  56.43 
 
 
304 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  55.36 
 
 
306 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.55 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.75 
 
 
310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  44.28 
 
 
301 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  50 
 
 
303 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  42.35 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  41.45 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  37.69 
 
 
292 aa  168  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  40.83 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  43.31 
 
 
326 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  38.15 
 
 
306 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.27 
 
 
315 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.05 
 
 
306 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  40.56 
 
 
311 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  41.34 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  41.34 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.28 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  41.34 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  41.34 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  41.34 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  41.34 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  41.34 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.3 
 
 
305 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  37.94 
 
 
309 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  40.75 
 
 
307 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  38.02 
 
 
311 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  38.52 
 
 
494 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  37.68 
 
 
296 aa  135  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.37 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  37.74 
 
 
414 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  40.77 
 
 
312 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.65 
 
 
321 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  36.58 
 
 
400 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  36.58 
 
 
400 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  37.06 
 
 
392 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  36.58 
 
 
392 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  36.58 
 
 
402 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  38.76 
 
 
519 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02859  integral membrane protein  42.04 
 
 
159 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
314 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  33.2 
 
 
302 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 
309 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  32.61 
 
 
318 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  29.43 
 
 
301 aa  99  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  32.21 
 
 
325 aa  96.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.25 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.06 
 
 
348 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.97 
 
 
304 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  29.43 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  29.43 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  29.43 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  30.34 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  27.86 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  32.97 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  27.97 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  28.62 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  29.33 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  28.79 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  30.29 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  27.31 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  26.82 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  30.07 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  30.35 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.35 
 
 
319 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  26.74 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>