More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1771 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  92.36 
 
 		 144 aa  270  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  91.67 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  91.67 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  91.67 
 
 		 144 aa  268  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  90.97 
 
 		 144 aa  266  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  90.97 
 
 		 144 aa  266  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  90.97 
 
 		 144 aa  266  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  90.97 
 
 		 144 aa  266  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  90.97 
 
 		 144 aa  266  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  62.5 
 
 		 144 aa  189  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  45.21 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  44.22 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  42.76 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  41.5 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  42.76 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  41.1 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  40.41 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  40.41 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  40.41 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  40.41 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  40.41 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  40.41 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  40.41 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  39.73 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  39.04 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  37.67 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  38.36 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  35.62 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  37.16 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  46.99 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  46.99 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  46.99 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  46.99 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  46.99 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  39.07 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  36.05 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  34.93 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  38.78 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  35.86 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  36.3 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  38.93 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  38.93 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  32.64 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  36.49 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  31.76 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  32.65 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  35.46 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.62 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  32.41 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  31.97 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  31.03 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.5 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.47 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.99 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  34.01 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.79 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  29.56 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.77 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  30.56 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  31.08 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.37 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  32.14 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  31.03 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.87 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  29.45 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  29.86 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  29.86 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  32.41 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  32 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  34.87 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  27.63 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  24.83 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  29.37 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  46.15 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  35.78 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  31.51 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  35.78 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  31.08 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  26.71 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  31.76 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  26.9 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  27.21 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  31.51 
 
 		 307 aa  53.9  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>