More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1702 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  84.84 
 
 		 700 aa  1266    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  84.84 
 
 		 700 aa  1266    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  84.99 
 
 		 700 aa  1268    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  84.84 
 
 		 700 aa  1268    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  99.43 
 
 		 706 aa  1447    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  100 
 
 		 706 aa  1453    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  85.27 
 
 		 700 aa  1272    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  77.2 
 
 		 728 aa  1150    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  84.84 
 
 		 700 aa  1266    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  99.58 
 
 		 706 aa  1449    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  85.41 
 
 		 700 aa  1271    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  99.58 
 
 		 721 aa  1449    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  54.2 
 
 		 709 aa  734    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  99.72 
 
 		 706 aa  1449    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  85.41 
 
 		 700 aa  1274    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  85.41 
 
 		 700 aa  1274    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  68.92 
 
 		 715 aa  1021    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  42.13 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  43.91 
 
 		 694 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  42.2 
 
 		 726 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.21 
 
 		 712 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  42.09 
 
 		 742 aa  500  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  43.63 
 
 		 697 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  41.09 
 
 		 736 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  40.99 
 
 		 706 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  40.9 
 
 		 710 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  41.03 
 
 		 681 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  39.89 
 
 		 743 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  40.72 
 
 		 731 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  37.02 
 
 		 701 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  38.52 
 
 		 705 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  37.55 
 
 		 706 aa  435  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  40.41 
 
 		 723 aa  432  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  39.49 
 
 		 723 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 688 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 675 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  33.47 
 
 		 691 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 		 678 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 705 aa  287  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 680 aa  257  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 696 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  25.24 
 
 		 701 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 770 aa  170  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 742 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  25.89 
 
 		 727 aa  155  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  27.77 
 
 		 797 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 736 aa  151  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 737 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 734 aa  150  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 703 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 726 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 780 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 681 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 711 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 791 aa  139  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 698 aa  137  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.47 
 
 		 762 aa  133  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 682 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 656 aa  130  6e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 692 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 730 aa  126  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 776 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 776 aa  125  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.67 
 
 		 688 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 681 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 757 aa  122  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  21.4 
 
 		 690 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  23 
 
 		 680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 774 aa  118  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 678 aa  117  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 705 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  25.11 
 
 		 659 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  25.97 
 
 		 713 aa  117  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 700 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  22.99 
 
 		 702 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  26.32 
 
 		 809 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 706 aa  114  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 778 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 705 aa  112  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 785 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 702 aa  110  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 786 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 715 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 717 aa  107  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 721 aa  107  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  25.88 
 
 		 809 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  25.74 
 
 		 809 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 		 782 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 721 aa  107  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 774 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  24.97 
 
 		 712 aa  106  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  25.64 
 
 		 712 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 809 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  25.35 
 
 		 782 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  22.66 
 
 		 787 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 688 aa  104  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  25.68 
 
 		 774 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 687 aa  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 777 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>