22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1663 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1663  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  352  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  94.55 
 
 		 110 aa  217  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  92.73 
 
 		 110 aa  213  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1616  hypothetical protein  91.55 
 
 		 71 aa  140  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.396977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1790  hypothetical protein  96.77 
 
 		 62 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2434  hypothetical protein  60.55 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2336  hypothetical protein  55.05 
 
 		 108 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110773  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2346  hypothetical protein  53.21 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000082368  hitchhiker  0.00160333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2233  hypothetical protein  53.21 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0210467  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2114  putative cytoplasmic protein  53.21 
 
 		 108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000392621  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2169  putative cytoplasmic protein  53.21 
 
 		 108 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000813161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2748  hypothetical protein  45.79 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4583  hypothetical protein  34.23 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5116  hypothetical protein  34.23 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4587  hypothetical protein  34.23 
 
 		 122 aa  51.2  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1727  hypothetical protein  82.61 
 
 		 69 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0940  protein of unknown function DUF1493  27.83 
 
 		 109 aa  44.7  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.255022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2476  hypothetical protein  25.42 
 
 		 125 aa  44.7  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5682  hypothetical protein  32.18 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0666  hypothetical protein  25.86 
 
 		 124 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131147  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0239  protein of unknown function DUF1493  31.34 
 
 		 71 aa  41.2  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2848  hypothetical protein  31.25 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308306  normal  0.122142 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>