272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1573 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1879  adenosine deaminase  99.4 
 
 
333 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.402444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  100 
 
 
333 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1711  adenosine deaminase  99.4 
 
 
333 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.804091  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1561  adenosine deaminase  99.1 
 
 
333 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000047707  normal  0.785767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1633  adenosine deaminase  99.4 
 
 
333 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201891  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2335  adenosine deaminase  89.76 
 
 
333 aa  617  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01592  adenosine deaminase  89.76 
 
 
333 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0859025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2019  adenosine deaminase  89.76 
 
 
333 aa  616  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00584459  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01582  hypothetical protein  89.76 
 
 
333 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0779462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2007  adenosine deaminase  89.76 
 
 
333 aa  616  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00173018  normal  0.960599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1698  adenosine deaminase  89.76 
 
 
333 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  89.76 
 
 
333 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  89.16 
 
 
333 aa  612  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1576  adenosine deaminase  89.16 
 
 
333 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.859905  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1825  adenosine deaminase  88.82 
 
 
332 aa  608  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0192108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1878  adenosine deaminase  79.7 
 
 
334 aa  544  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1993  adenosine deaminase  79.7 
 
 
334 aa  544  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2251  adenosine deaminase  78.79 
 
 
332 aa  532  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2337  adenosine deaminase  72.73 
 
 
337 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00582  adenosine deaminase  70 
 
 
334 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2142  adenosine deaminase  70.39 
 
 
337 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.757317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2036  adenosine deaminase  71.21 
 
 
337 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.96683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001910  adenosine deaminase  69.09 
 
 
334 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2323  adenosine deaminase  69.88 
 
 
334 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1904  adenosine deaminase  68.07 
 
 
337 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1455  adenosine deaminase  65.44 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  62.88 
 
 
331 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  62.58 
 
 
331 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  61.96 
 
 
331 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  62.27 
 
 
331 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0046  adenosine deaminase  61.66 
 
 
331 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.105714  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  61.66 
 
 
331 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4494  adenosine deaminase  61.35 
 
 
331 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.290189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4352  adenosine deaminase  61.35 
 
 
331 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4297  adenosine deaminase  61.04 
 
 
331 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  63.61 
 
 
332 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  61.66 
 
 
331 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  62.88 
 
 
331 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1979  adenosine deaminase  55.83 
 
 
331 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  59.52 
 
 
332 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2501  adenosine deaminase  36.47 
 
 
359 aa  193  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  34.97 
 
 
376 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  34.65 
 
 
393 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  35.06 
 
 
374 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  34.66 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  34.36 
 
 
376 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1121  adenosine deaminase  31.8 
 
 
331 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3524  adenosine deaminase  31.83 
 
 
331 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0385  adenosine deaminase  32.32 
 
 
336 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.0257625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1770  adenosine deaminase  38.24 
 
 
332 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  30.45 
 
 
354 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3392  adenosine deaminase  28.92 
 
 
331 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  30.58 
 
 
338 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0815  adenosine deaminase  32.62 
 
 
364 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.407539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  30.58 
 
 
365 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4185  adenosine deaminase  31.21 
 
 
364 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  30.86 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0684  adenosine deaminase  30.24 
 
 
362 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.467946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1279  Adenosine deaminase  31.53 
 
 
359 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  26.95 
 
 
332 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  29.23 
 
 
335 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6446  adenosine deaminase  31.04 
 
 
356 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  31.72 
 
 
337 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  27.16 
 
 
332 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  30.43 
 
 
353 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  35.29 
 
 
340 aa  149  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  34.87 
 
 
340 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4841  adenosine deaminase  32.35 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.486752  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  32.41 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1592  adenosine deaminase  32.26 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0478787  normal  0.265955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05460  adenosine deaminase  30.03 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  30.77 
 
 
346 aa  146  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  33.53 
 
 
366 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1162  adenosine deaminase  28.49 
 
 
402 aa  146  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3935  adenosine deaminase  31.21 
 
 
372 aa  146  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0943553  hitchhiker  0.00189819 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  26.22 
 
 
330 aa  145  9e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3533  adenosine deaminase  29.76 
 
 
373 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0451471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5933  adenosine deaminase  30.27 
 
 
364 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  decreased coverage  0.0016274 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  28.4 
 
 
338 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1406  adenosine deaminase  30.18 
 
 
333 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000107989  hitchhiker  2.2737200000000002e-26 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  28.93 
 
 
339 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  36.97 
 
 
348 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  29.5 
 
 
337 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  31.78 
 
 
343 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1259  adenosine deaminase  31.67 
 
 
362 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1233  adenosine deaminase  31.67 
 
 
362 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1250  adenosine deaminase  31.67 
 
 
362 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.292543  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  31.79 
 
 
350 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0759  adenosine deaminase  31 
 
 
364 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  30.42 
 
 
316 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  31.03 
 
 
356 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  25.46 
 
 
335 aa  142  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  30.77 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  29.05 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  33.22 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  29.02 
 
 
354 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  30.1 
 
 
316 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  27.59 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  31.83 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1320  adenosine deaminase  30.99 
 
 
363 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0285514  normal  0.854573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>