More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1568 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1568  electron transport complex protein RnfB  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0321479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1884  electron transport complex protein RnfB  99.48 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1628  electron transport complex protein RnfB  99.48 
 
 		 192 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0262939  normal  0.320495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1556  electron transport complex protein RnfB  98.96 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0733084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1716  electron transport complex protein RnfB  98.96 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.270473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01598  electron transport complex protein RnfB  89.06 
 
 		 192 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000941545  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2013  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  89.06 
 
 		 192 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000144398  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2001  electron transport complex protein RnfB  89.06 
 
 		 192 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000498524  normal  0.338717 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01588  hypothetical protein  89.06 
 
 		 192 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1704  electron transport complex protein RnfB  89.06 
 
 		 192 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1571  electron transport complex protein RnfB  89.06 
 
 		 192 aa  354  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.144341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1836  electron transport complex protein RnfB  89.06 
 
 		 192 aa  354  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.912519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2340  electron transport complex protein RnfB  89.06 
 
 		 192 aa  354  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.297329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1817  electron transport complex protein RnfB  88.54 
 
 		 192 aa  353  6.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0338518  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1820  electron transport complex protein RnfB  82.29 
 
 		 192 aa  313  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1895  electron transport complex protein RnfB  73.8 
 
 		 207 aa  294  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2007  electron transport complex protein RnfB  73.8 
 
 		 207 aa  294  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2253  electron transport complex protein RnfB  73.8 
 
 		 188 aa  293  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0146582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2024  electron transport complex protein RnfB  71.88 
 
 		 192 aa  284  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2324  electron transport complex protein RnfB  71.35 
 
 		 192 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2240  electron transport complex protein RnfB  73.96 
 
 		 190 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000443884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2155  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  68.06 
 
 		 196 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1917  electron transport complex protein RnfB  66.15 
 
 		 191 aa  253  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1871  electron transport complex protein RnfB  60.21 
 
 		 194 aa  240  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00186515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02730  electron transport complex protein RnfB  57.59 
 
 		 193 aa  234  8e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000653403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2173  electron transport complex protein RnfB  58.12 
 
 		 193 aa  231  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0287954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0737  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  57.69 
 
 		 184 aa  230  9e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1849  electron transport complex protein RnfB  56.99 
 
 		 199 aa  228  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000101519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2509  electron transport complex protein RnfB  56.02 
 
 		 193 aa  227  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2065  electron transport complex protein RnfB  56.02 
 
 		 193 aa  227  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1910  electron transport complex protein RnfB  56.02 
 
 		 193 aa  227  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000153045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2169  electron transport complex protein RnfB  56.02 
 
 		 193 aa  227  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000157134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2111  electron transport complex protein RnfB  57.53 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0389991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2064  electron transport complex protein RnfB  57.53 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000222941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2966  electron transport complex protein RnfB  57.07 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0244352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2274  electron transport complex protein RnfB  57.53 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000478609  normal  0.512145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2354  electron transport complex protein RnfB  55.98 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.720002  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2260  electron transport complex protein RnfB  56.99 
 
 		 199 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4546  electron transport complex protein RnfB  56.99 
 
 		 199 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1544  electron transport complex protein RnfB  59.89 
 
 		 198 aa  223  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831464 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02965  electron transport complex protein RnfB  62.87 
 
 		 197 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0537  electron transport complex protein RnfB  64.46 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.05126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2557  electron transport complex protein RnfB  54.84 
 
 		 189 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002948  electron transport complex protein RnfB  63.86 
 
 		 198 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00169587  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2198  electron transport complex protein RnfB  56.45 
 
 		 189 aa  216  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.401389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18930  electron transport complex protein RnfB  59.78 
 
 		 188 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000143693  normal  0.123767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1831  electron transport complex protein RnfB  59.02 
 
 		 189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101638  normal  0.0584321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1864  electron transport complex protein RnfB  58.06 
 
 		 205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.164914  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19260  electron transport complex protein RnfB  60 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.772376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1403  electron transport complex protein RnfB  57.95 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.466807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2043  electron transport complex protein RnfB  57.74 
 
 		 189 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0243874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1639  electron transport complex protein RnfB  56.82 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1791  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.32 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445554  hitchhiker  0.00820964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1174  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  58.58 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2067  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  57.14 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0305749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2894  electron transport complex protein RnfB  56.73 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2627  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  54.02 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1060  electron transport complex protein RnfB  55.56 
 
 		 196 aa  201  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3233  electron transport complex protein RnfB  56.18 
 
 		 183 aa  200  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2016  electron transport complex protein RnfB  54.8 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0937  electron transport complex protein RnfB  55.97 
 
 		 192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1786  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  53.41 
 
 		 192 aa  194  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1162  electron transport complex protein RnfB  50.56 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2400  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfB  55.06 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.942423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1035  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50.59 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0689  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.63 
 
 		 181 aa  178  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0763573  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0815  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  54.19 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0720  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  53.94 
 
 		 681 aa  167  6e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2823  electron transport complex, B subunit  45.66 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2121  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  56.72 
 
 		 335 aa  156  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2705  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.97 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4509  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  55.3 
 
 		 404 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000389854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4148  iron-sulfur cluster-binding protein  56.06 
 
 		 291 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1015  ferredoxin  52.52 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0219422  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3887  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  54.07 
 
 		 291 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0850  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.08 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.223684  normal  0.0952897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0994  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  52.08 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0262542  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2928  ferredoxin  54.48 
 
 		 137 aa  145  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0307  electron transport complex protein  49.25 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1884  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  49.25 
 
 		 213 aa  143  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3310  ferredoxin  51.8 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1754  ferredoxin  55.22 
 
 		 139 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1680  ferredoxin  55.22 
 
 		 139 aa  142  4e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1236  ferredoxin  52.82 
 
 		 279 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1714  ferredoxin  49.66 
 
 		 342 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2326  ferredoxin  49.66 
 
 		 342 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2349  ferredoxin  49.66 
 
 		 306 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0951  ferredoxin  44.63 
 
 		 320 aa  141  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2794  hypothetical protein  48.59 
 
 		 204 aa  140  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2940  hypothetical protein  51.56 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0937  ferredoxin  49.66 
 
 		 276 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1047  ferredoxin  49.3 
 
 		 248 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0830  putative electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  50 
 
 		 280 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.214006  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01788  ferredoxin  52.63 
 
 		 142 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2096  ferredoxin  49.34 
 
 		 291 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5668  ferredoxin  48.28 
 
 		 334 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50970  Electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  46.1 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0817561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2245  ferredoxin  48.28 
 
 		 341 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.666336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0971  ferredoxin  48.92 
 
 		 282 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2365  ferredoxin  48.28 
 
 		 339 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>