81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1441 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1424  putative outer membrane protein  100 
 
 
241 aa  496  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.284815  decreased coverage  0.000282683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1456  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  496  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.273825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1441  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  496  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0990956  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2017  putative outer membrane protein  99.59 
 
 
241 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.277986  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1844  putative outer membrane protein  99.59 
 
 
241 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476612  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1967  hypothetical protein  89.21 
 
 
252 aa  455  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1722  hypothetical protein  88.8 
 
 
289 aa  454  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.346331 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1803  hypothetical protein  89.21 
 
 
252 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000450339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1941  hypothetical protein  89.21 
 
 
252 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00616425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1910  hypothetical protein  89.21 
 
 
252 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.155146  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1469  hypothetical protein  89.21 
 
 
252 aa  455  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0334595  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2440  hypothetical protein  89.21 
 
 
252 aa  455  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.350144  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01679  hypothetical protein  88.8 
 
 
252 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01691  hypothetical protein  88.8 
 
 
252 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1920  protein of unknown function DUF481  88.8 
 
 
252 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0878  hypothetical protein  58.3 
 
 
254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.428575  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3223  hypothetical protein  56.09 
 
 
255 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3360  hypothetical protein  56.09 
 
 
255 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.853104  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2903  hypothetical protein  57.5 
 
 
229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00154459  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0606  hypothetical protein  37.61 
 
 
250 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2051  hypothetical protein  27.88 
 
 
248 aa  88.6  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000194447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1079  protein of unknown function DUF481  29.03 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03209  putative orphan protein  28.51 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000209719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1569  hypothetical protein  24.08 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3931  hypothetical protein  26.51 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  26.05 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.070466 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3261  hypothetical protein  26.48 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014751  hitchhiker  0.0000121737 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0686  hypothetical protein  26.48 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000157748  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0700  hypothetical protein  25.2 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000147849  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1087  hypothetical protein  27.27 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000312385  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0668  putative salt-induced outer membrane protein  26.52 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000204125  hitchhiker  0.000000158177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2754  hypothetical protein  27.81 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.716555  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0752  hypothetical protein  24.5 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00298481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0756  hypothetical protein  26.51 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.189796  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4213  hypothetical protein  24.88 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195016  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0710  hypothetical protein  25.57 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.410698  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  24.31 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0756  hypothetical protein  25.34 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216313  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0370  hypothetical protein  26.29 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.397767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1585  hypothetical protein  27.93 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  23.87 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3644  hypothetical protein  25.11 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0792  hypothetical protein  24.32 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0731  protein of unknown function DUF481  25.11 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000132441  hitchhiker  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0740  hypothetical protein  25.11 
 
 
247 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000500329  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3536  hypothetical protein  26.79 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  26.24 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3285  hypothetical protein  25.57 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0505048  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3349  hypothetical protein  25.89 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000236372  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3461  protein of unknown function DUF481  26.79 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0831  hypothetical protein  26.79 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.221265  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3655  hypothetical protein  26.34 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3246  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0777  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0484485  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002336  membrane protein  26.44 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00499723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3352  hypothetical protein  22.33 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03211  putative salt-induced outer membrane protein  24.89 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000342266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  23.87 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2781  hypothetical protein  26.09 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100538  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0880  hypothetical protein  24.85 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0878  hypothetical protein  26.9 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000368102  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3065  putative salt-induced outer membrane protein  24.12 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124339  normal  0.234711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3358  hypothetical protein  22.87 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000013403  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3529  protein of unknown function DUF481  32.06 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3587  hypothetical protein  23.72 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.204251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0934  hypothetical protein  25.45 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00019  hypothetical protein  24.64 
 
 
254 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1224  hypothetical protein  28.46 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3357  putative salt-induced outer membrane protein  25.69 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000088366  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1257  putative salt-induced outer membrane protein  27.69 
 
 
293 aa  53.1  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1233  hypothetical protein  22.75 
 
 
268 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0046  putative salt-induced outer membrane protein-like  25.97 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.843258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1713  Putative salt-induced outer membrane protein-like protein  26.44 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0964751  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2054  hypothetical protein  26.44 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0514  hypothetical protein  21.4 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0608195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04136  hypothetical protein  24.07 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.580295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3855  hypothetical protein  26.71 
 
 
305 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.248641  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3877  hypothetical protein  20.83 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1110  hypothetical protein  21.46 
 
 
249 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1733  hypothetical protein  23.33 
 
 
317 aa  46.6  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0231419  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0753  Salt-stress induced outer membrane protein  23.75 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>